网站1 siDirect设计网站 贴入RNA 的NCBI序列号及序列信息(FASTA格式),点击design siRNA. 网站会给出一系列的siRNA及其他判断信息,如Tm值,脱靶效应等。 网站2 DSIR设计网站 填入RNA名字及序列(FASTA格式),选择Run analysis。 网站会按照评分高低,将设计的siRNA排序,且去掉评分在90分以下得siRNA,我们只要选择排在前面...
1) siDirect设计网站http://sidirect2.rnai.jp/ 2) DSIR设计网站http://biodev.extra.cea.fr/DSIR/DSIR.html 3 )invivogen设计网站http://www.invivogen.com/sirnawiza 4)https://www.sigmaaldrich.cn/CN/en/semi-configurators/shrna?activeLink=productSearch 个人建议最好将基因信息交给公司帮助设计,...
(2)序列特异性 确保siRNA 在靶序列之外没有高于总序列碱基数目 78% 的相同碱基。
2.LifeTechnologies网站 LifeTechnologies公司有个非常实用的在线shRNA设计软件,操作非常方便,而且设计出来的shRNA不再需要到NCBI上Blast,直接可以用的。首先打开网站:,在TargetDesignOptions处选中shRNA,以Fli1为例,输入Accessionnumber或Nucleotidesequence,其他条件不变:下拉到底点击RNAiDesign,然后出现推荐的10...
Ss正义序列，As为反义序列
Ss正义序列，As为反义序列
设计一个高效且用户友好的siRNA设计网站需要综合考虑用户体验和功能实用性,清晰简洁的导航设计是关键,确保用户能够轻松找到所需的工具和资源,提供直观易懂的界面设计,利用图表和交互式元素展示siRNA设计过程中的重要信息,比如靶标选择、序列设计及优化等步骤,网站应包含详尽的帮助文档和教程,...