- 描述:人类初级细胞数据集,包含各种细胞类型的信息。 BlueprintEncodeData 📊 - 来源:Blueprint (Martens and Stunnenberg 2013) 和 Encode (The ENCODE Project Consortium 2012) - 描述:人类编码数据集,适用于多种细胞类型的注释。 DatabaseImmuneCellExpressionData 🛡️ - 来源:Database for Immune Cell ...
目前SingleR内置的数据库有7个,5个人的数据库HumanPrimaryCellAtlasData、BlueprintEncodeData、DatabaseImmuneCellExpressionData、MonacoImmuneData、NovershternHematopoieticData;2个小鼠的数据库ImmGenData、MouseRNAseqData。内置数据库中只有一些整体的注释,无法满足对特定组织区域的细胞注释的需求,因此需要参考文献或者细胞类...
-SingleR/vignettes/SingleR.Rmd at master · LTLA/SingleR (github.com) 细胞亚群注释神器SingleR把它的参考数据库放在了celldex包 - 知乎 (zhihu.com) install.packages("devtools")library(devtools)install_github("LTLA/SingleR")install.packages("remotes")remotes::install_github("LTLA/celldex")library(Sin...
直接抄作业!!!💕SingleR 细胞类型初步定义: SingleR 是对单细胞转录组数据进行细胞类型自动注释的 R 包,它通过已知类型的细胞样本作为参考数据集,对数据集中与参考集相似的细胞进行标记注释。💕SingleR 对每个细胞 - Claire科研学姐于20240308发布在抖音,已经
新手小白也看懂的转录组细胞类型鉴定!!❗️❗️❗️单细胞转录组细胞类型鉴定👍👍👉SingleR原理简介 SingleR是对单细胞转录组数据进行细胞类型自动注释的R包,它通过已知类型的细胞样本作为参考数据集,对数据集中与参考集相似的 - Claire科研学姐于2
SingleR的7个参考注释数据集(5个人+2个鼠)Th**er 上传902.16MB 文件格式 gz SingleR的7个参考注释数据集(5个人+2个鼠) 点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:1 积分 电信网络下载 佳能清零万能V8.8 清零+教程 2025-01-22 23:38:02 积分:1 微控-一款手机操作电脑的蓝牙应用 2025-01-22 07:02:52 积分:...