Single-cell ATAC-seq (scATAC-seq) technology has also been developed to study cell type-specific chromatin accessibility in tissue samples containing a heterogeneous cellular population. However, due to the intrinsic nature of scATAC-seq data, which are highly noisy and sparse, accurate extraction ...
Epi ATAC Epi Multiome 细胞核分离试剂盒 特色资源 细胞核分离试剂盒的产品说明 细胞核分离试剂盒测试过的组织 从FFPE样本中分离细胞核 从FFPE组织切片中分离细胞核,用于标准的Chromium基因表达Flex流程。 产品 Flex 特色资源 示范方案 全血固定 在Flex分析的上游对全血进行固定,然后分离出外周血单核细胞(PBMC)和白细...
以改善我们对肿瘤生物学，肿瘤微环境和治疗反应的理解，并且scRNA-seq即将被用于改善临床决策。
单细胞RNA测序(scRNA-seq)可以在单细胞水平上获取基因表达谱,帮助我们更好地理解生物系统的异质性。单细胞分析已经扩展到其他组学领域,如单细胞ATAC-seq和CITE-seq,分别用于测量染色质的可及性和蛋白质表达。…
ezSingleCell平台的单细胞多组学(Single cell multiomics)模块通过整合单细胞RNA测序、ATAC-seq和蛋白质组学数据,提供全面的生物学分析解决方案(图7)。该模块支持多种数据格式的输入,并利用高级算法消除不同组学数据间的批次效应,确保分析结果的一致性和可靠性。用户可以在统一界面中进行数据预处理、降维和聚类分析,探...
ezSingleCell是一个面向实验室科学家的集成的一站式单细胞和空间分析 Web服务器,由五个模块组成,每个模块都旨在为一种数据类型或任务提供全面的工作流程。此外,ezSingleCell允许不同模块在统一界面内进行交互,接受多种格式的数据输入,例如文本格式(csv 和 tsv)或 10x Cell Ranger/Space Ranger/Cell Ranger-ATAC 输...
ed CRISPR screening with single-cell transcriptome readout (doi:10.1038/ nmeth.4227)”文章,创造性地将CRISPR-Cas9和单细胞RNA测序两种极有前景的基因组学领域结合在一起,发明了这种被称作CROP-seq的单细胞测序方法 (CRISPR droplet sequencing, CRISPR液滴测序), 能大规模完成前所未有的高通量基因调控的分析。
Single-cell assay for transposase-accessible chromatin by sequencing (scATAC-seq) has emerged as a powerful tool for dissecting regulatory landscapes and cellular heterogeneity. However, an exploration of systemic biases among scATAC-seq technologies has
ed CRISPR screening with single-cell transcriptome readout (doi:10.1038/ nmeth.4227)”文章,创造性地将CRISPR-Cas9和单细胞RNA测序两种极有前景的基因组学领域结合在一起,发明了这种被称作CROP-seq的单细胞测序方法 (CRISPR droplet sequencing, CRISPR液滴测序), 能大规模完成前所未有的高通量基因调控的分析。