Simplot主要通过对待分析的序列和参考序列进行相似性作图,通过绘制的点图判断目的序列是否存在重组:(1)当参考序列的点图呈现近似平行线时,说明目的序列与其中某条参考序列的序列高度相似,不存在重组信号;(2)当参考序列的点图呈交叉时,说明可能存在重组信号。如下图所示,11株病毒菌株在整个基因组长度上表现出高度的相似...
首先,你要把这个基因的起始位点标出来,就给这么点序列,不好给你分析.上面的DNA序列也不像从头开始的啊.下面的RNA序列也不知道是从什么地方开始的.这段基因到底是在基因的什么位置?设计realtimePCR引物,一般选择mRNA的前边部分,另外,你这段序列的长度也不够,一共才119bp,扩增出来也不好区分,建议设计...
现需要序列重组分析软件SimPlot，但本人无法下载。下载地址：https://sray.med.som.jhmi.edu/SCRoftware/...
如题，谢谢哈 我的邮箱seewindow@yahoo.com.cn
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采用SimPlot软件对全基因组序列进行相似性分析,判断重组特征。 1.6 组织血型抗原(histo-blood group antigen,HBGA)结合位点分析 将本研究诺如病毒分离株与其他GII.P16-GII.2病毒株及GII.2型参考株SMV/1976各基因氨基酸序列进行比较,分析HBGA结合位点的氨基酸序列变异情况。
现需要序列重组分析软件SimPlot，但本人无法下载。下载地址：https://sray.med.som.jhmi.edu/SCRoftware/...