图3 PCA-X 模型结果 图4 主成分拟合模型 我觉得你关心的得分图和载荷图 以上展示的是关于模型的一些结果,然后我们还关心的是 score plot(图5)。由于在默认参数时,软件只给出了 1 个主成分,这不足以来显示得分图,所以我增加(图4)了 1 个主成分来做得分图(图5)。得分图最下面一排的 R2X[1],R2X[2]...
打开SIMCA软件并载入数据,进行PCA分析。在PCA图窗口中,选择“Scores”或“Loadings”选项卡,分别查看得分图或载荷图。在“Scores”或“Loadings”选项卡上方的工具栏中,找到“Ellipse”图标,点击打开“Ellipse Setup”窗口。在“Ellipse Setup”窗口中,选择需要添加置信椭圆的分组,可以选择“Groups”中已...
在SIMCA中,要在PCA图中添加置信椭圆,可以按照以下步骤操作:打开SIMCA软件并载入数据,进行PCA分析。在PCA图窗口中,选择“Scores”或“Loadings”选项卡,分别查看得分图或载荷图。在“Scores”或“Loadings”选项卡上方的工具栏中,找到“Ellipse”图标,点击打开“Ellipse Setup”窗口。在“Ellipse Setup”窗口中,选择需要...
PCA:初步了解不同样品之间的差异。PCA得分图中的圆圈表示95%的置信区间,圈外的点表示该样本的代谢谱和其他的所有分析样本的代谢谱的差异性大,可以剔除也可以不剔除,建议保留。 PLS-DA:与PCA最大的区别在于PCA是无监督分析,不知道是哪组,用R2Y和Q2进行模型评价。 OPLS-DA:与PLS-DA的区别在于消除与分类(如对照...
Finish后默认PCA>Autofit即可 各种PCA下的各种图 修改模型参数(如定义分组)right click空白区域(project window)>edict Model,在advanced mode下修改 Class可以定义分组 右Click图形区域>Format Plot 修改图形参数 PCA下的HCA:菜单栏analysis>HCA 参数设置(分类参数,颜色)right click图形空白>properties ...
点击右边图像overview界面,即可得到想要的图形(得分图、载荷图、二维/三维的主成分分析图等)。 在图形区域, 右键点击-选择Fromat plot:调整图形的各种显示(坐标轴、颜色、大小、标题等) 右键点击-选择Save as:保存做好的图 补充: 一、主成分分析( PCA )是通过几个变量组合来解释原来多个变量的一种方法,满足数据...
图形区域提供调整显示选项,如通过右键点击"Format plot"调整坐标轴、颜色、大小、标题等。此外,右键点击"Save as"保存图形。主成分分析(PCA)是将多变量组合到少数几个变量,实现数据降维,同时保留更多信息。它通过空间映射方式,将数据映射到低维空间,使每个变量在新空间的方差达到最大。PCA载荷表示...
小提示:在数据整理时就要将训练集与测试集分开,这点很重要哟,关系着是否能成功建立PCA-Class模型。 2.数据导入 3.自动拟合 4.添加主成分 5.创建分组模型的DModX图表 6.更改横坐标名称 7.更改颜色 此时DModX图表是内部验证,数据是训练集40的个样本。红线为95%置信区间,图中F组超过置信区间说明两组样本区分较大...
生物图整合了得分图与载荷图,以更直观的方式展示样本与变量的关系。生物图中的坐标经过变换,但核心在于理解样本和变量在不同主成分方向上的表达。总结:解读SIMCA PCA结果时,需要关注主成分的数量和解释能力,理解交叉验证对模型泛化能力的评估,以及通过得分图、载荷图和生物图等可视化工具来深入理解样本...
Finish后默认PCA>Autofit即可 各种PCA下的各种图 修改模型参数(如定义分组)right click空白区域(project window)>edict Model,在advanced mode下修改 Class可以定义分组 右Click图形区域>Format Plot 修改图形参数 PCA下的HCA:菜单栏analysis>HCA 参数设置(分类参数,颜色)right click图形空白>properties ...