首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。 第二步在Omics skin模式下进行P值的获取。 S-plot图除了常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,也可以用S-plot来筛选Biomarkers。 截图中Ctr或Par方式下是呈S型的,UV是做出来是直线 功能小贴士 在PCA或OPLS-DA得分图中右击选择For...
昨日,但是有一个任务在身,无奈笔者并没有用过这个Simca软件。因此,花了一晚上时间学了这个软件的一些需求操作步骤。吐槽,下载和安装这个软件花了笔者不少功夫。。。首先购买一个正版Simca软件,然后安装,记得别装系统盘即可。。。然后可以开始对着傻瓜式教程操作了。 1. 先打开软件 2. 打开目标数据表格 3. 加载 。
首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。 第二步在Omics skin模式下进行P值的获取。 S-plot图除了常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,也可以用S-plot来筛选Biomarkers。 截图中Ctr或Par方式下是呈S型的,UV是做出来是直线...
VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。 第二步在Omics skin模式下进行P值的获取。 S-plot图除了常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05...
各位虫友:SIMCA怎么求拟合方程的P值?谢谢。
4.0万 25 13:00 App SIMCA14.1的基本操作(包含p值、vip值、置换检验等) 2446 0 13:14 App SIMCA 14.1中针对图片进行美化(包括字体,背景,标题等) 4353 0 25:05 App SIMCA14.1的使用辅助指导 1.7万 13 21:46 App 代谢组学有关SIMCA的使用 1920 1 03:23 App Simca作图是直线不成圆怎么办? 4410 5 11...
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各位虫友:SIMCA怎么求拟合方程的P值?谢谢。
l设定筛选条件:foldchange>2andP<0.05 l用颜色进行区分 采自代谢组 真实数据~ 不一定完全 对称~ 操作: 操作环境:SIMCA14.1(Omicsskin)+Excel 步骤: l建立OPLS-DA模型(详见之前教学案例) l顺序点击:View--Omicsskin—home—Descriptivestatistics l得到:Probability(P值)和Foldchange ...