本视频主要讲述关于GC-MS、电子鼻仪器的学术论文解读,并结合SIMCA如何做OPLS-DA分析(仅占视频的一小部分),以及讲述差异代谢物筛选、PCA、HCA、OAV、雷达图、指纹图谱等。,讲的不好的地方还请多多担待。, 视频播放量 5.2万播放、弹幕量 40、点赞数 1090、投硬币枚数 539
SIMCA14软件的使用(HCA、PCA、OPLS-DA分析), 视频播放量 1795、弹幕量 0、点赞数 11、投硬币枚数 6、收藏人数 21、转发人数 3, 视频作者 在学习的小鱼丸, 作者简介 中药学研二|复方神经药理方向欢迎私信交流,相关视频:SIMCA14软件的使用(2),SIMCA14的使用(3),主成
在弹出的对话框中选择Regression PLS or OPLS,然后点击Tabbed mode,在Observations选项卡下,保留要分析的组,在Scale选项卡下,Ctrl + A全选, Fig4.PNG Type选择set,点击确定。 Fig5.PNG 弹出对话框,选择确定。
OPLS-DA分析(以L5 VS WT为例) 为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。 VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)...
OPLS-DA着眼于病毒的代谢组学特征和病毒结构,以及将其与其他已知病毒或物质进行比较的一种方法。这种方法,特别是当直接嵌入仪器中时,使您更容易看到差异和病毒株的共同点。 SIMCA软件(特别是与提供有针对性的图形和分析的OMICS skin一起使用时)可以简化对OMICS数据的MVDA分析以及生物标记物和病毒机制的识别。
simcaoplsda解读 《simcaoplsda解读》是对多元统计分析方法PLS-DA的解读和应用。PLS-DA是一种基于偏最小二乘回归(PLS)方法的分类模型,用于处理具有多个自变量和一个或多个因变量的数据。本文将介绍PLS-DA的基本原理、模型构建方法、模型评估指标、解释和应用等方面的内容。同时,也将重点介绍在生命科学领域中,如何...
为了检验OPLS-DA有无过拟合,进行随机分组200次的置换检验。 VIP数值已导出,按照常规筛选差异物方法VIP>1 P<0.05,那还需要进行Students’t-test分析,获得P值,SIMCA也可以进行相应的分析,具体如下: 首先开启Omics skin功能(File-Options-Simca options-Skins-Enable Omics skin-Yes)。
正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA) 建立模型(同上述操作),在对样本分组之后选择OPLS-DA模型。 打开网易新闻 查看精彩图片 拟合模型,分析数据。 打开网易新闻 查看精彩图片 不足之处,还请指正。 原创文章,欢迎转载。^_^ 欢迎点击文末原文链接,关注如沐风科研中医药平台(基础科研+直播课+文献),一起探讨学习!小编微...
SIMCA的OPLS-DA相关 技术标签:机器学习 转自阿趣代谢微信公众号 1. 去除离群值后新做的PCA分析还有很多样本离群,这种情况正常吗? 正常,因为样本本身并不是独立的关系,存在组间差异和组内差异。 2.OPLS-DA中score图t旁边的数字说是权重,是什么的权重?有什么含义? t[1]是针对预测主成分(横坐标)的回归系数...
simca软件OPLS-DA/PLS-DA/PCA分析简单操作 花重失锦容 8.5万47 01:17 SIMCA 14.1.0 多元数据分析安装包一键安装下载教程,新手快速学会 bili_82974853447 06:41 SIMCA14的使用(3) 在学习的小鱼丸 21160 05:28 3.3.1PLS-DA简介 仙人球的杂货铺 1.7万3 ...