:(a) 在适应阶段,细胞在轻的和重的 SILAC 培养基中生长,直到重的细胞完全融入重的氨基酸(红星)。这使得两个 SILAC 细胞池可以通过 MS 完全区分(黑点和红星,分别表示轻和重 SILAC 肽),然后可以混合并作为一个样品处理。适应阶段可以包括细胞扩增以达...
这使得两个 SILAC 细胞池可以通过 MS 完全区分 (黑点和红星,分别表示轻和重 SILAC 肽),然后可以混合并作为一个样品处理。适应阶段可以包括细胞扩增以达到实验所需的皿数。 (b) 在第二阶段,两个细胞群被不同的处理,诱导蛋白质组的变化。混合样品,亚蛋白质组可通过富集步骤或其他分离纯化,消化成肽作为一个单一池...
:(a) 在适应阶段,细胞在轻的和重的 SILAC 培养基中生长,直到重的细胞完全融入重的氨基酸(红星)。这使得两个 SILAC 细胞池可以通过 MS 完全区分(黑点和红星,分别表示轻和重 SILAC 肽),然后可以混合并作为一个样品处理。适应阶段可以包括细胞扩增以达到实验所需的皿数。 :(b) 在第二阶段,两个细胞群被不同的...
SILAC实验包括适应和实验阶段。适应阶段,细胞分别在轻和重标记的氨基酸培养基中生长,确保MS可区分轻重标记肽。实验阶段则诱导蛋白质组变化,通过混合处理后的细胞裂解物,进行蛋白质酶解、肽富集和LC-MS/MS鉴定定量[1]。选择的标记氨基酸应为细胞生存必需且不影响代谢的,如亮氨酸、赖氨酸和精氨酸,其中...
基于SILAC的定量MS即利用依赖质谱的SILAC技术进行蛋白质定量鉴定,其鉴定的原理是将正常必需氨基酸(轻标记)和同位素修饰氨基酸(重标记)掺入细胞培养物中,使新合成的蛋白质带上轻、重同位素标记,然后提取并消化细胞中的蛋白质进行LC-MS/MS分析,根据质谱中峰值强度的比率可进行相对蛋白质丰度的量化。
SILAC 能够在同一 MS 运行中对来自不同测试样品的这些分子进行相对和可比较的量化,最终最大限度地减少由 MS 仪器在不同运行中造成的样品注入和离子抑制导致的结果的错误变异性。 SILAC实验技术于2002 年首次引入,作为南丹麦大学实验生物信息学中心 (CEBI) 的一种代谢标记技术。 准确地说,在活细胞的生长培养基中使用...
SILAC 培养基中生长,直到重的细胞完全融入重的氨基酸(红星)。这使得两个 SILAC 细胞池可以通过 MS ...
是一种自下而上的非靶向标记蛋白质质谱定量技术,基于SILAC的定量MS即利用依赖质谱的SILAC技术进行蛋白质定量鉴定,其鉴定的原理是将正常必需氨基酸(轻标记)和同位素修饰氨基酸(重标记)掺入细胞培养物中,使新合成的蛋白质带上轻、重同位素标记,然后提取并消化细胞中的蛋白质进行LC-MS/MS分析,根据质谱中峰值强度的比率...
SILAC蛋白组或SILAC定量蛋白组学,是指利用SILAC技术对蛋白质组进行定量研究。百泰派克生物科技提供基于SILAC标记的定量蛋白组分析服务。SILAC 在基于质谱(MS)的定量蛋白质组学中,SILAC(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture)是通过在细胞培养过程中加入稳定同位素标记的氨基酸对样品进行标记后结合质谱...
SILAC | 基于质谱 (MS) 的定量蛋白质组学技术 基于质谱的定量蛋白质组学已成为生物学研究的有力工具,而质谱本质上是不能用于蛋白质定量分析的,因为不同的蛋白质和多肽具有不同的离子化效率,而稳定同位素标记的氨基酸(如2H(D),13C,15N 和18O)引入蛋白质中可以很好的解决这个问题。