先说结论:SHARE-seq 与以往几个技术 (sci-CAR、Paired-seq、SNARE-seq) 相比,实验流程更科学、DNA/RNA捕获率更高。下面展开。 首先,要明白评价单细胞组学技术的2个最重要指标: 1) "捕获率" 简单地理解,捕获率就是“测到的片段/细胞里本来有的片段”(DNA或RNA),翻译一下就是“测量值/真实值”。在可...
本文首发:生物技术大观 公众号 最近CELL杂志在线发表了可以同时检测单细胞染色质开放性和转录组的文章,这个可以在单细胞中同时检测染色质开放性和转录组的SHARE-seq技术全称为Simultaneous High-throughput ATAC…
SHARE-seq 提供了一个精确的染色质可及性和基因表达的联合测量策略 该技术在单次实验中可以构建多达一百万个单细胞的文库,而花费仅不到一千美元。在保持检测灵敏度的基础上,该技术大大提高了检测通量,为对复杂系统的大规模测序打下了基础。文章做了四种细胞系,三种小鼠组织样本(肺,脑,皮肤)共84,426个单细胞,...