Shapeit是一个专门用于推断基因组单体型(Phasing)的软件,它和beagle一样是当前用得最多的两个基于群体LD进行单倍型推断的软件,使用场景和算法彼此间大同小异。它目前的最新版是Shapeit3,但是常用的还是Shapeit2,也是在千人基因组项目中主要应用的版本。而Shapeit3主要是针对超大规模人群,一般是量级在几万人规模的...
Shapeit是一个专门用于推断基因组单体型(Phasing)的软件,它和beagle一样是当前用得最多的两个基于群体LD进行单倍型推断的软件,使用场景和算法彼此间大同小异。它目前的最新版是Shapeit3,但是常用的还是Shapeit2,也是在千人基因组项目中主要应用的版本。而Shapeit3主要是针对超大规模人群,一般是量级在几万人规模的基因组...