SeuratData是一种使用R的内部包和数据管理系统以Seurat对象的形式分发数据集的机制。它为用户提供了一种简单的方法来访问在Seurat视图中使用的数据集。 SeuratData包存放在Github上面,所以下载的时候需要使用devtools去下载安装 devtools::install_github('satijalab/seurat-data') Github的包有时候会下载失败,如果下载失败...
SeuratData是一种使用R的内部软件包和数据管理系统以Seurat对象形式分发数据集的机制。它为用户提供了一种访问Seurat小插曲中使用的数据集的简便方法。 安装 SeuratData的安装可以通过devtools完成 devtools::install_github('satijalab/seurat-data') Getting Started ...
https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages R中install.packages("SeuratData")显示无法使用 Warning in install.packages : package ‘SeuratData’ is not available for this version of R 使用remotes包 ,详细使用办法见链接 https://remotes.r-lib.org/ 安装 insta...
然后再在Rstudio中手动安装 install.packages('/local/txm/software/SeuratData/pbmcMultiome.SeuratData_0.1.0.tar.gz', repos = NULL, type = "source") 大功告成: Installingpackageinto'/local/txm/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0'(as'lib'isunspecified)*installing*source*package‘pbmcMultiome.S...
删除R包: remove.packages("tidyverse",.libPaths()) 指定版本安装: remotes::install_version("SeuratObject",version="4.1.4") 版本解决后,我们可以看到Rstudio中的包版本为: 并且当我们完成样本整合后,得到整合后的counts与data。 @counts:未作任何处理的原始 RNA表达矩阵 。 @data:原表达矩阵通过 NormalizeDa...
尝试安装|包源:|spatstat.utils_3.0-1.tar.gz| install.packages("E:/下载/spatstat.utils_3.0-1.tar.gz",repos=NULL,type="source")WARNING:Rtoolsisrequiredtobuild R packages butisnot currently installed.Please downloadandinstall the appropriate version of Rtools before proceeding:https://cran.rstudi...
R中install.packages("SeuratData")显示无法使用 Warning in install.packages : package ‘SeuratData’ is not available for this version of R 使用remotes包 ,详细使用办法见链接 https://remotes.r-lib.org/ 安装 install.packages("remotes") 命令 ...