3.利用Bioperl或者Biopython里面的工具解析文件,然后再写脚本个性化分析。(鉴于python的速度,这里推荐Bioperl) 下面具体介绍如何使用Bioperl的SeqIO模块解析fastq格式文件。 首先是安装Bioperl。 sudoapt-getinstallperlbrewsudoperlbrewinstall-cpanmsudo/path/cpanm Bio::Perl 解析head10000.fastq 文件的前四行(第一条序列...
conda install biopython # 此命令默认(捆绑)安装python 今早一开始也还是报错,同样error,source后正常。 source ~./bashrc python XXX.py python3 XXX.py 不论python还是python3都正常运行了 还是不清楚问题出在哪里,但有一点值得注意: 报错时,调动的是root用户安装的python 正常运行时,即source ~./bashrc 之后,...