这样,通过增加虚机数量并行计算大大缩短计算时间,另一方面,每个子任务也不用把完整的gVCF文件全部读入。最终,每个joint-calling子任务会产生覆盖各自区域的局部VCF文件。Sentieon的joint-calling模块效率远高于GATK,分布式处理1万个样本的joint-calling只需要不到2万个核时。 接下来,将这些局部VCF文件合并为一个完整的包含...
MSSNG队列的joint-calling分析离不开DNAstack, Sentieon和MSSNG研究团队的密切合作。Sentieon的CCDG等效流程生成了快速,可重复,并且可扩展的分析结果。Sentieon和DNAstack团队的通力合作,在分析流程搭建中,使用了一系列创新的解决方案来克服分析速度、大文件IO操作等性能瓶颈,大大缩短了处理时间,提高了后续分析的效率。我们...
Sentieon软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2金标准的数学模型，在保证结果完全匹配GATK/BWA金标准的前提下，分析效率提升15~20倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案，最大可处理10万个WGS样本的Joint Calling，无需中间步骤。Sentieon软件全面兼容X86 & ARM CPU架构，纯软件方案，无需编译，即...
Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2等金标准的数学模型,在保证完全匹配开源分析方案结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据分析效率。 Se...
在大型数据(>200K样本)中的Joint-Calling中不合并中间文件。 与常见疾病基因组中心(Centers for Common Disease Genomics)具有等效功能。 纯软件解决方案,可以运行在任何基于通用CPU的系统中。 PrecisionFDA Consistency Challenge获奖者。 PrecisionFDA Truth Challenge获奖者。
Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS、WES、Panel、ctDNA、RNA等基因数据分析效率。Sentieon为来自于分子诊断,药物研发,临床医疗等多个领域的合作伙伴和科研机构提供软件解决方案,共同推动基因技术的发展。
DNAscope joint calling with non-Salus datasets; Supports WGS and WES; Read more Accelerated BWA/GATK Compliant Pipelines Concordant with BWA-MEM, STAR, Minimap2, Picard and GATK for drop-in replacement, and 10x faster. Compute Cost Reduction on Generic Hardware ...
[Sentieon软件](Sentieon基因数据分析加速软件 -官方试用下载)忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型,在保证结果完全匹配GATK/BWA金标准的前提下,分析效率提升10倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,最大可处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。为了方便用...
Sentieon® Sequencer Agnostic Secondary Analysis- FASTQ-BAM-VCF-GVCF CPU/ARM accelerated software for drop-in replacements/improvements for BWA-MEM, STAR, Minimap2, GATK, Mutect2, and large cohort joint calling. DNAscope pipeline supports both short reads and long reads from all mainstream sequen...
Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS、WES、Panel、ctDNA、RNA等基因数据分析效率。Sentieon为来自于分子诊断,药物研发,临床医疗等多个领域的合作伙伴和科研机构提供软件解决方案,共同推动基因技术的发展。