准确率(Accuracy 精确率(Precision) 灵敏度(Sensitivity)(Recall) 特异度(Specificity) 真实值是positive,模型认为是positive的数量(True Positive=TP) 真实值是positive,模型认为是negative的数量(False Negative=FN) 真实值是negative,模型认为是positive的数量 ROC, SRO
这是一个非常非常高的准确率,即 sensitivity = specificity = 0.99!)。 现在,我们想计算的是,如果一个人的测试结果呈阳性,他实际上患有这种疾病的概率是多少(即P(疾病|阳性))。 (初步感觉和结论:即使测试的准确率非常高,但由于人群中得病的先验概率非常非常低,所以即使测试是阳性,最终得病的结果概率也可能不高...
在考虑我们预测的阴性结果,里面有多少是假阴性,也就是有多少第二类错误。 False positive rate (FPR):假阳性率,给你一堆金标准的阴性,有多少是假的阴性,等于1-specificity,1-准阴性不就是假阴性吗。 Confusion matrix混淆矩阵 / Contingency table列联表 (这个表的两种名称) 基于sensitivity和specificity衍生出来的...
在考虑我们预测的阴性结果,里面有多少是假阴性,也就是有多少第二类错误。 False positive rate (FPR):假阳性率,给你一堆金标准的阴性,有多少是假的阴性,等于1-specificity,1-准阴性不就是假阴性吗。 Confusion matrix混淆矩阵 / Contingency table列联表 (这个表的两种名称) 基于sensitivity和specificity衍生出来的...
#!/usr/bin/env python # Author: LI ZHIXIN importsys importpysam fromcollectionsimportOrderedDict defclassify_DP(depth): ifdepth >101: return21 return((depth-1)//51) defparse_rec(rec): sample=list(rec.samples)[0] # filter the Invalid line ...
[0, 0] FP = confusion[0, 1] FN = confusion[1, 0] print('Accuracy:',(TP+TN)/float(TP+TN+FP+FN)) print('Sensitivity:',TP / float(TP+FN)) print('Specificity:',TN / float(TN+FP)) y = [] pred = [] auc = roc_auc_score(y,pred) print('AUC:',auc) calculate_metric(y...
特异性specificity:顾名思义,就是你的方法能指定地判断出阴性的能力,我给你一堆金标准的阴性结果,你会不会误判出一些阳性的结果。这个命名还是欠缺形象性,叫准阴性更贴切。 FDR:常用于多重检验下的p-value矫正;伪发现率,其意义为是 错误拒绝(拒绝真的(原)假设)的个数占所有被拒绝的原假设个数的比例的期望值...
敏感性、特异性（sensitivityandspecificity）假阳性、假阴性 FDR第。。。这些概念确实很难记忆，长时间不⽤很容易忘记。此⽂可以帮你快速回忆起这些概念，同时不涉及任何绕⼝的专业术语。1. 记住基本框架，⾦标准和预测结果，没有这两个概念就没有敏感性和特异性了。以上指标都是⽤于衡量我们（预测）⽅法...
Sensitivity测量被正确识别的实际阳性的比例 (tp /(tp + fn))。Specificity测量被正确识别的实际负数的比例 (tn /(tn + fp))。 该指标创建四个局部变量,true_positives,true_negatives,false_positives和false_negatives,用于计算给定灵敏度下的特异性。计算给定灵敏度值的阈值并用于评估相应的特异性。
to which one CDR belongs based on the known group of the most similar CDR. By checking whether the predicted group is correct or not, we can evaluate both sensitivity (fraction of CDRs from a group that are correctly predicted to be in that group) and specificity (fraction of CDRs predic...