多组学深度整合:创新性地将scRNA-seq、scTCR-seq、CITE-seq与mIF空间蛋白组学联合,构建“克隆→转录→空间”一体化免疫图谱。 系统性与机制性结合:通过伪时序、TCR共享、GSEA等多重分析,从细胞命运轨迹到基因程序演变进行全方位阐释。 技术驱动创新:充分运用了单细胞和空间组学前沿技术,契合社论中对AI、空间
而在单细胞水平分析TCR的价值在于:针对特定的TCR alpha-beta链配对介导抗原特异性,我们都可以获得与之相对应的配对信息。这对于深入了解抗原识别,靶向免疫治疗TCR的有效设计至关重要,也有助于确立T细胞群的祖先关系。 日前重磅推出的SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit, 为那些寻求在单细胞水平上进行的T细胞受体...
(combined.TCR,cloneCall="strict",chain="both",scale=TRUE)# 指定自定义分组进行统计clonalQuant(combined.TCR,cloneCall="gene",group.by="sample",scale=TRUE)##克隆丰度 ---clonalAbundance(combined.TCR,cloneCall="gene",scale=FALSE)#密度图clonalAbundance(combined.TCR,cloneCall="gene",scale=TRUE)##...