单细胞多组学研究方案可以从单个细胞中获取更多信息,发现隐藏的线索,加深对生物学的理解。10x单细胞多组学ATAC + 10x基因表达研究方案(scATAC-seq+scRNA-seq),可通过一个简单的流程将同一单细胞的基因表达和A…
本研究结合scRNA-seq和scATAC-seq对四个时期的胎儿大脑皮层细胞进行联合分析,完成了人大脑皮层发生过程中各细胞类型的单细胞基因表达和调控图谱,发现了在皮层发生过程中,一系列可以通过染色质开放性预测表达水平的基因,进一步的深入研究,发现了神经元和...
前期从未对来自大型SSc患者群体的皮肤样本进行全面的scRNA-seq分析,包括SSc的不同临床谱系,此外,调节SSc纤维化的主要驱动因素和基本机制在很大程度上仍然未知。 研究方法 该研究对56名健康对照组、97名疾病进展不同阶段的SSc患者、另外10名患有其他纤维化皮肤疾病的患者(皮肤组织、外周血)进行了单细胞转录组MARS-seq分...
前期从未对来自大型SSc患者群体的皮肤样本进行全面的scRNA-seq分析,包括SSc的不同临床谱系,此外,调节SSc纤维化的主要驱动因素和基本机制在很大程度上仍然未知。 研究方法 该研究对56名健康对照组、97名疾病进展不同阶段的SSc患者、另外10名患有其他纤维化皮肤疾病的患者(皮肤组织、外周血)进行了单细胞转录组MARS-seq分...
在真核生物发育过程中,转录因子和DNA的相互结合所驱动的基因表达顺式作用元件(cis-regulatory element, CRE)活力的动态变化在细胞表型转化中起中心作用。在单细胞的尺度上衡量染色质开放性(例如scATAC-seq)有助于精确理解CRE的活性变化,尤其与单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)相结合,可以帮助解析不同转录因子如何协同...
在真核生物发育过程中,转录因子和DNA的相互结合所驱动的基因表达顺式作用元件(cis-regulatory element, CRE)活力的动态变化在细胞表型转化中起中心作用。在单细胞的尺度上衡量染色质开放性(例如scATAC-seq)有助于精确理解CRE的活性变化,尤其与单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)相结合,可以帮助解析不同转录因子如何协同...
单细胞多组学测序的最新进展,如单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq),现在使我们能够在单细胞分辨率下探索肿瘤间和肿瘤内的异质性、细胞发育、细胞图谱、神经科学的奥秘,为深入了解疾病机制和开发诊疗策略提供了新的视角。本月最新发表了许多利用细胞RNA+ATAC测序技术的研究成果,小编这里...
发现一个2022年发表的题为"WGBS combined with RNA-seq analysis revealed that Dnmt1 affects the methylation modification and gene expression changes during mouse oocyte vitrification"似乎能给我带来一些分析思路上的启示,一读摘要,其中赫然写着scRNA-Seq(single cell RNA sequencing)和scWGBS(single cell whole ...
发现一个2022年发表的题为"WGBS combined with RNA-seq analysis revealed that Dnmt1 affects the methylation modification and gene expression changes during mouse oocyte vitrification"似乎能给我带来一些分析思路上的启示,一读摘要,其中赫然写着scRNA-Seq(single cell RNA sequencing)和scWGBS(single cell whole ...
在初步的 sc/snRNA-seq 实验中确定的一些差异表达基因可能需要上述方法中的一种或多种,甚至其他方法进行验证。 Table 1 Overview of common validation methods 表1:常见验证方法概述 Para_02 在此我们讨论这些验证方法的一些通用用例和示例(见框1和表1)。