由于存在着肽段定量的不确定性估计、数据缺失、批次效应和高噪声等问题阻碍了对单细胞蛋白质组学数据的分析，且现有针对单细胞转录组的方法无法完全解决该问题，作者提出了一种多任务异方差回归模型和基于图对比学习的细胞嵌入方法scPROTEIN。实验表明scPROTEIN在细胞聚类、批次校正、细胞类型注释、临床分析和分析空间蛋白...
图2 scPROTEIN下游设计框架 实验结果 3.1细胞聚类和肽的不确定性评估 KNN和批处理校正(KNN-ComBat)方法常用于对单细胞蛋白质组学数据进行分析。作者利用scPROTEIN方法定量分析了SCoPE2_Specht数据集上的3,042种蛋白质的1,490个细胞,并与现有的单细胞蛋白质组学数据分析流程进行了比较。图3a展示了不同的基于图的嵌...
作者利用scPROTEIN方法定量分析了SCoPE2_Specht数据集上的3,042种蛋白质的1,490个细胞,并与现有的单细胞蛋白质组学数据分析流程进行了比较。图3a展示了不同的基于图的嵌入聚类后的效果,可以发现scPROTEIN在SCoPE2_Specht数据集上的所有评估指标方面都取得了最好的性能(图3b)。对于Scanorama和Liger,两种细胞类型之间...
2024年3月19日,南开大学张瀚团队与腾讯AI实验室姚建华团队联合在Nature Methods上发表了文章scPROTEIN: a versatile deep graph contrastive learning framework for single-cell proteomics embedding(scPROTEIN: 一种用于单细胞蛋白质组学嵌入的...
scPROTEIN can estimate the uncertainty of peptide quantification, denoise protein data, remove batch effects and encode single-cell proteomic-specific embeddings in a unified framework. We demonstrate that scPROTEIN is efficient for cell clustering, batch correction, cell type annotation, clinical ...
Protein Gels NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris Gel 1.0 mm, 10 well box of 10 gels NP0321BOX NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris Gel 1.0 mm, 12 well box of 10 gels NP0322BOX NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris Gel 1.0 mm, 15 well box of 10 gels NP0323BOX NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris Gel...
scPROTEIN, which consists of peptide uncertainty estimation based on a multitask heteroscedastic regression model and cell embedding generation based on graph contrastive learning. scPROTEIN can estimate the uncertainty of peptide quantification, denoise protein data, remove batch effects and encode single-...
产品名称:PROSC重组蛋白 基因名: PLPBP Uniprot No.: O94903 别名: FLJ11861; Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein; Proline synthetase co transcribed bacterial homolog; Proline synthetase co transcribed homolog (bacterial); PROSC; PROSC_HUMAN 种属: Homo sapiens (Human...
英文名 BCCP(SC) protein 英文别名 BCCP(SC) protein 您刚刚浏览过 BCCP(SC) protein 刚刚更新的化工产品 10154-11-7 10154-09-3 101523-81-3 101492-47-1 101492-37-9 101492-32-4 101492-23-3 101492-21-1 101491-48-9 101491-43-4 101491-34-3 101418-50-2 101418-47-7 101418-27-3...
Validation Data Gallery SCIN fusion protein Ag2168 SDS-PAGEEnlarge Image¥1080/ 50 μg Cat No. Ag2168 库存:3-4周货期 Size 收藏 大规格包装请咨询报价 点击咨询售前客服 点击咨询售后客服 Product Information Peptide Sequence MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRGFTYRLHFW...