这种类型的R包被称为single-cell pipeline,为我们提供了俯瞰整个单细胞分析流程的便捷途径,让我们能够站在R包的肩膀上,轻松应对单细胞数据的挑战。 而今天,小果要向大家介绍一款更进阶的R包——SCP(single-cell pipeline),它不仅提供了高级的单细胞分析功能,例如拟时序分析、速率分析等,还拥有各种美观大气的数据可视...
这种类型的R包被称为single-cell pipeline,为我们提供了俯瞰整个单细胞分析流程的便捷途径,让我们能够站在R包的肩膀上,轻松应对单细胞数据的挑战。 而今天,小果要向大家介绍一款更进阶的R包——SCP(single-cell pipeline),它不仅提供了高级的单细胞分析功能,例如拟时序分析、速率分析等,还拥有各种美观大气的数据可视...
今日我们分享的方法,SCP,参考地址在Single Cell Pipeline • SCP,这个地方是一系列软件的合成,当然,也有创新。 大家同时也可以参考老俊俊的方法,也非常不错,github.com/junjunlab/Cl。 SCP需要R和python的联合环境使用 if (!require("devtools", quietly = TRUE)) { install.packages("devtools") } devtools:...
最终,结合产生数据的技术背景和生物学背景,借助各类工具全方位、多角度的探索数据,才可以在分析中有效推断出微观世界所发生着的各类事件,才可以对上述问题做出更自信的回答。 SCP (Single-Cell Pipeline) SCP是一个端到端单细胞数据分析管道,可实现数据从下机后的处理、分析、共享和发表的全部工作。管道意味着极简、...
SCP (Single-Cell Pipeline) SCP是一个端到端单细胞数据分析管道,可实现数据从下机后的处理、分析、共享和发表的全部工作。管道意味着极简、标准化、模块化,SCP的特点是简洁、全面、高效,让单细胞的科学研究更专注于科学本身。 SCP中的所有方法根据分析类型主要分为三个模块,包括了数据预处理模块、下游分析模块和可...
SCP: Single-Cell PipelineSCP provides a comprehensive set of tools for single-cell data processing and downstream analysis.The package includes the following facilities:Integrated single-cell quality control methods. Pipelines embedded with multiple methods for normalization, feature reduction, and cell ...
SCP (Single-Cell Pipeline) SCP是一个端到端单细胞数据分析管道,可实现数据从下机后的处理、分析、共享和发表的全部工作。管道意味着极简、标准化、模块化,SCP的特点是简洁、全面、高效,让单细胞的科学研究更专注于科学本身。 SCP中的所有方法根据分析类型主要分为三个模块,包括了数据预处理模块、下游分析模块和可...
because certain other abatements are too time-sensitive to delay. Some of the Anomalous effects of the waste we process can worsen the longer they're kept in the pipeline, and that's not even getting into what it does to the pipes themselves. When we perform the flush, they're often alr...
今日我们分享的方法,SCP,参考地址在Single Cell Pipeline • SCP,这个地方是一系列软件的合成,当然,也有创新。 大家同时也可以参考老俊俊的方法,也非常不错,https://github.com/junjunlab/ClusterGVis。 SCP需要R和python的联合环境使用 if(!require("devtools",quietly=TRUE)){install.packages("devtools")}devto...
而今天,小云要向大家介绍一款更进阶的R包——SCP(single-cell pipeline),它不仅提供了高级的单细胞分析功能,例如拟时序分析、速率分析等,还拥有各种美观大气的数据可视化图。这款R包是由南京医科大学生殖医学博士亲自编写,可见其专业性与实用性。 SCP R包是一套强大的单细胞数据处理和分析工具,提供了全面的解决方案...