scMLnet不仅可以模拟细胞间通信,还可以模拟细胞内基因调控网络。其基于细胞类型特异性基因表达、先验网络信息和统计推断,整合了细胞间通路(配体-受体相互作用)和细胞内子网络(受体-TF 通路和 TF-靶基因相互作用)。这意味着,scMLnet 可用于使用 scRNA-seq 数据预测细胞内基因表达的微环境调节因子,并了解细胞间通讯的功...
scMLnet是一个R软件包,用于根据单细胞RNA-seq表达数据构建细胞间/细胞内多层信号交换网络。 scMLnet通过基于细胞类型特异性基因表达,先验网络信息和统计推断,整合细胞间途径(配体-受体相互作用)和细胞内子网络(受体-TF途径以及TF-靶基因相互作用),构建多层网络。 scMLnet还可以可视化中央细胞和邻近细胞之间构建的细胞间...
scMLnet_0.1.0.tar.gz README scMLnet Introduction scMLnet is an R package developed to construct inter-/intracellular multilayer singaling network based on single-cell RNA-seq expression data. scMLnet constructs the multilayer network by integrating intercellular pathways (ligand-receptor interactions) ...
Scribe Markup Language (ScML) describes document elements based on their structural function and articulates the relationships among elements. Paragraph Styles Book bk Book Title: The full book title. bk1 Book Title Level 1: The book subtitle, one level down from the main book title. bk2 ...
中山大学孙小强教授团队于2020年开发了一种 scRNA-seq 数据驱动的多层网络方法 (scMLnet)。scMLnet不仅可以模拟细胞间通信,还可以模拟细胞内基因调控网络。其基于细胞类型特异性基因表达、先验网络信息和统计推断,整合了细胞间通路(配体-受体相互作用)和细胞内子网络(受体-TF 通路和 TF-靶基因相互作用)。这意味着,...
中山大学孙小强教授团队于2020年开发了一种 scRNA-seq 数据驱动的多层网络方法 (scMLnet)。scMLnet不仅可以模拟细胞间通信,还可以模拟细胞内基因调控网络。其基于细胞类型特异性基因表达、先验网络信息和统计推断,整合了细胞间通路(配体-受体相互作用)和细胞内子网络(受体-TF 通路和 TF-靶基因相互作用)。这意味着,...
中山大学孙小强教授团队于2020年开发了一种 scRNA-seq 数据驱动的多层网络方法 (scMLnet)。scMLnet不仅可以模拟细胞间通信,还可以模拟细胞内基因调控网络。其基于细胞类型特异性基因表达、先验网络信息和统计推断,整合了细胞间通路(配体-受体相互作用)和细胞内子网络(受体-TF 通路和 TF-靶基因相互作用)。这意味着,...