Install the scripts using the git program to clone the bbi-lab/bbi-sciatac-demux and bbi-lab/bbi-sciatac-analyze repositories on your computer. Use the commands git clone https://github.com/bbi-lab/bbi-sciatac-demux git clone https://github.com/bbi-lab/bbi-sciatac-analyze For efficienc...
单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)技术能揭示基因调控和表观遗传异质性的单细胞分辨率细节,但由于数据的高维性和极端稀疏性,通过scATAC-seq进行细胞标注仍然具有挑战性。现有的细胞标注方法主要关注细胞峰值矩阵,并没有充分利用基因组序列。作者提出了一种名为SANGO的方法,通过整合scATAC数据中可达性峰周围的基因组序列...
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本文作者首先利CRISPR-cas9和RNA-seq技术,从PTEN缺陷前列腺癌(PCa)细胞中筛选到了调控染色质重构的BRG1,接着利用一些列CoIP及Western实验验证了PTEN是通过PTEN/AKT/GSK3β/FBXW7轴来调控BRG1的泛素化降解,以此来调控BRG1的稳定性。然后,利用RNA-seq、ChIP-seq及ATAC-seq联合分析BRG1调控的下游靶基因,并进一步证明了...
纽约基因组中心(NYGC)和纽约大学(NYU)的内维尔·桑贾纳博士实验室的研究人员开发了CRISPR-SciATAC,这是一种新的综合性基因筛选平台,联合捕获CRISPR基因微扰和单细胞染色质可达性基因组范围。利用这项技术,他们分析了基因组组织中的变化,并创建了一个大规模的图谱,说明单个染色质改变酶的丢失如何影响人类基因组。新方法...
Celem polaczenia metod zwalczania zagrozenia tapaniami byla koniecznosc ograniczenia zagrozenia poprzez odsuniecie i dezintegracje przestrzeni sklonnych do gromadzenia naprezen, co umozliwilo kopalni na bezpieczna eksploatacje pokladu 713/1-2.Slawomir OlechowskiMateusz Gwiekala...
单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)技术能揭示基因调控和表观遗传异质性的单细胞分辨率细节,但由于数据的高维性和极端稀疏性,通过scATAC-seq进行细胞标注仍然具有挑战性。现有的细胞标注方法主要关注细胞峰值矩阵,并没有充分利用基因组序列。作者提出了一种名为SANGO的方法,通过整合scATAC数据中可达性峰周围的基因组...
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