CUT&Tag(染色质免疫共沉淀测序)是研究目标蛋白质与DNA互作的方法,是研究表观遗传调控的重要手段之一,其被广泛应用于全基因组组蛋白修饰、转录因子和其他蛋白-DNA互作的研究。该技术已被广泛应用在肿瘤、发育、疾病表型及机理研究和细胞图谱构建等领域的研究。但是,和bulk RNA-seq一样,CUT&Tag只能在整体水平上研究蛋...
结果显示H3K27me3的scCUT＆Tag分析可区分人血中的细胞类型，并允许从异质组织生成特定细胞类型的多梳基团（PcG）景观。此外，他们使用scCUT＆Tag对治疗前后脑肿瘤患者的H3K27me3进行了分析，鉴定了肿瘤微环境中的细胞类型以及主要样品和治疗后PcG活性的异质性。作者（Henikoff）和方法（ scCUT&Tag），大家会不会有点...
Technologies that profile chromatin modifications at single-cell resolution offer enormous promise for functional genomic characterization, but the sparsity of the measurements and integrating multiple binding maps represent substantial challenges. Here we introduce single-cell (sc)CUT&Tag-pro, a multimodal ...
Technologies that profile chromatin modifications at single-cell resolution offer enormous promise for functional genomic characterization, but the sparsity of the measurements and integrating multiple binding maps represent substantial challenges. Here we introduce single-cell (sc)CUT&Tag-pro, a multimodal ...
Henikoff团队在本文中,针对bulk CUT&tag技术,巧妙“嫁接”10x单细胞捕获平台,将每个细胞标记上特定的barcode,实现单细胞分辨率的蛋白-DNA互作关系研究。 研究策略 样品:小鼠中枢神经系统的成千上万个细胞,PBMC细胞; 检测靶标:活跃启动子、增强子和基因体(H3K4me3、H3K27ac和H3K36me3);非活性区(H3K27me3); ...