提供易于使用的包装函数,以导入Seurat或其他常见R包不支持的输出格式的文件(例如,CellBender)。 辅助函数简化分析,通过添加新的默认参数或将多行代码包装成单个函数。 scCustomize安装 按照Install提示下载scCustomize及其依赖包 其中Nebulosa包,专门用于基于核密度估计的单细胞数据可视化。由于
scCustomize是一个单细胞转录组数据可视化的R包,里面集合了一些常用的数据可视化方法,可以与Seurat包进行很好的联用,支持Seurat,LIGER和SCE等常用对象的数据。 image.png R包安装 直接使用devtools包进行安装 devtools::install_github(repo="samuel-marsh/scCustomize")remotes::install_github(repo="samuel-marsh/scCus...