拟南芥SBP转录因子基因家族分析
研究结果表 明,SBP 基因家族为绿色植物所特有,在拟南芥基因组中有 16 个基因座,其基因结构差异很 大,经可变剪接得到 27 个转录本,编码 16 个 SBP 转录因子,其蛋白质序列 DNA 结合结构域 保守序列为 79 个氨基酸残基,含两个互不重叠的锌指结构序列模体。基因结构、系统发育和 蛋白质序列保守结构域分析表明,...
系统发育分析显示单子叶植物玉米和水稻的SBP基因保守性更强、亲缘关系更近; 共鉴定37个SBP基因, 分布在9条染色体上; 通过基因分析注释以及启动子功能预测, 进一步发现SBP家族基因参与植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应、花器官发育以及植物光反应等过程。并且...
葡萄SBP基因家族生物信息学分析
摘要SBP基因家族是植物体中特异性存在的一类重要转录因子,主要功能是调控生物生长以及细胞分化。此次研究采用生物信息学的方法,对拟南芥SBP蛋白序列进行系统进化分析,并为其构建了系统发育树。由试验结果可以得出,拟南芥SBP基因家族共包括30个成员,分布在4条染色体上,其分布比较集中,分成三大亚族。拟南芥SBP蛋白具有的生物...
大豆SBP基因家族的序列特征、表达及进化分析
组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥的SBP基因家族之间的联系。结果显 示着42条蛋白序列与拟南芥l6条SBP蛋白序列一起被分成了7个亚族,拟南芥与苹果SBP基因间具有较高的保守性。基 因组定位结果显示42条SBP基因分布在12条染色体上。研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序...
顺式作用元件分析表明, PmSBP启动子区富含逆境胁迫,光反 应及激素信号响应元件.基因表达模式分析表明, PmSBP基因表达具有明显的组织特异性,品种特异性及发育阶段特异性, 表明SBP基因在糜子生长发育中发挥重要作用.研究结果为揭示SBP基因在糜子生长发育中的生物学功能奠定了基础, 也 为其它作物SBP基因研究提供了借鉴...
大豆SBP基因家族的序列特征_表达及进化分析
OsSBP 分别形成 7 对和 31 对直系 同源基因.顺式作用元件分析表明, PmSBP 启动子区富含逆境胁迫,光反应及激素信号响 应相关元件.基因表达模式分析表明, PmSBP 基因具有明显的组织表达特异性, 双粒糜子 和单粒糜子中 PmSBP 表达模式不同, 抽穗期和开花期的表达趋势存在差异.研究结果为揭 示 SBP 基因在糜子生...