理化性质分析显示,工业大麻SBP家族成员氨基酸数目在171~1053aa之间,相对分子量为19.12~116.71kD,等电点介于5.98~9.57之间;对拟南芥、水稻和工业大麻SBP蛋白进行聚类分析,51个SBP蛋白被分为11个亚组,16个CsSBPs分布于7个亚组中;在CsSBPs基因启动子区域检测到多个顺式作用元件,包含光响应、激素诱导元件、逆境响应
1.3 玉米SBP转录因子的分类 利用ClustalX 2.1软件[21]对玉米SBP转录因子的SBP保守域蛋白序列进行多序列比对, 结合比对结果与水稻、拟南芥SBP转录因子的分类依据, 进行玉米SBP转录因子的分类。 1.4 玉米SBP转录因子的系统发育关系 首先, 从玉米、拟南芥和水稻的SBP转录因子中提取完整SBP结构域(包括I组成员N端和C端的SB...
拟南芥SBP转录因子基因家族分析
Riechmann 1 拟南芥 SBP 转录因子基因家族分析 北京大学 罗静初 等通过文献检索,收集整理了已知植物转录因子家族,预测了拟南芥基因组共编码 1533 个转 录因子,占拟南芥总基因数 5.9%,其中45%是植物特异转录因子(Riechmann et al., 2000 )。 2003 年,北大-耶鲁合作中心等研究组对拟南芥全基因组转录因子进行了...
SBP转录因子基因家族是一个植物的特异转录因子家族,SBP基因都含有一段保守的核苷酸序列即DNA结合结构域,又称为SBP盒(SBP-box),SBP盒编码的蛋白质序列称SBP结构域(SBP-domain),含79个氨基酸残基,并具有高度保守性。该研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与大豆基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准,共得...
野生葡萄SBP转录因子cDNA序列进行分析,根据其保守区,非保守区设计引物,分别构建以保守区和非保守区为目的基因的RNAi植物表达载体,通过花序浸润法转化拟南芥,初步了解SBP家族基因的功能.获得以下主要结果: 1.分别构建了中国野生葡萄SBP转录因子cDNA保守区和非保守区的RNAi植物表达载体.通过对中国野生葡萄SBP转录因子cDNA进行...
摘要:SBP转录因子家族作为植物特异性的转录因子具有重要的生物学功能,广泛参与花和果实发育等诸多生命过程。利 用普通烟草(Nicotianatabacum)TN90基因组数据,通过隐马尔科夫模型检索,SMART和Pfam分析,鉴定了普通烟草SBP 转录因子家族成员;通过多序列比对鉴定并分析了普通烟草SBP结构域的结构特征;通过邻接法、极大似然法进行...
从全基因组水平研究蒺藜苜蓿SBP-box转录因子基因家族,系统地鉴定出22个SBP-box家族基因,根据基因结构分析、结构域的差异和系统发育分析将这些SBP-box基因分成5个亚家族.基因比较分析表明SBP-box基因家族扩张主要是通过部分复制及串联重复事件来实现的.基因表达模式分析表明蒺藜苜蓿SBP-box基因具有器... 查看全部>> ...
专利名称 一种水稻SBP‑box转录因子基因及其应用 申请号 2014108433896 申请日期 2014-12-31 公布/公告号 CN104450744B 公布/公告日期 2017-07-07 发明人 兰涛,吴为人,张淑君,汪斌,刘婷婷,林格格,官华忠 专利申请人 福建农林大学 专利代理人 蔡学俊 专利代理机构 福州元创专利商标代理有限公司 专利类型 发明专利 ...
本发明公开了一类柳枝稷SBP‑box类转录因子在增加植物生物量和可发酵糖产量方面的应用,属于植物基因工程技术领域。其主要内容包括柳枝稷SBP‑box类转录因子PvSPL1和2的基因克隆和序列测定,然后在此基础上利用嵌合抑制子沉默技术(CRES‑T),抑制整个PvSPL1和2转录因子亚家族的转录活性,从而产生分蘖数目增加的转基因...