最近一项研究表明，S蛋白（D614G）突变增加了SARS-CoV-2的可传播性，并推测这种替代突变或是在不同S蛋白序列中发现的其他突变可能会影响抗体识别。为了确定D614G突变是否会影响抗体的结合，我们在COV21和COV57 nsEMPEM重建和C105-S冷冻电镜结构上标记了D614残基和其他残基的位置，这些残基是此前研究报道的突变位点。...
数据表明,SARS-CoV-2变体在多碱基裂解位点附近携带的突变对GalNAc-T3和T7的糖基化效率有显著影响。SARSCoV-2早期变体(α和δ)携带的P681处的单一突变可能使病毒能够抵抗宿主细胞糖基化,但在最新的omicron变体中引入额外的N679K突变可能会使病毒再次容易受到宿主细胞糖基化调节。 GalNAc-T3和T7的过度表达抑制了人...
与野生型病毒相比，最初的Omicron-BA.1基因组的Spike区有35个突变，包括30个氨基酸替换，3个缺失，3个氨基酸插入。其中15个突变位于受体结合域(RBD)，这是病毒与宿主细胞的主要结合部位，也是中和抗体的靶点，因此它们具有重要的临床意义。对于突变位点的研究和初步数据表明，Omicron比以前的变种传播更快，更容易逃避抗...
以最近的几篇研究为例，2020年2月17日，广东省疾控中心在预印本medRxiv的一篇研究表明广东的SARS-CoV-2和武汉早期的SARS-CoV-2 基因组之间几乎没有发生突变【1】；2月19日，中科院西双版纳热带植物园在预印本ChinaXiv上传的研究通过分析93个样本的基因组数据发现仅有120个核苷酸位点发生突变，这些突变均匀分散在10...
作为一种单链β属冠状病毒,SARS-CoV-2利用宿主机制进行复制。刺突蛋白是SARS-CoV-2感染的关键包膜糖蛋白,其组装成三聚体,分为两个亚基,S1和S2,它们之间包含弗林蛋白酶切割位点。S1亚基主要负责血管紧张素转换酶2(ACE2)的初始相互作用和结合,而S2亚基则实现膜融合。
NTD少数关键突变位点是变构控制点 为了确定除D614G 突变外,还有哪些突变在SARS-CoV-2的传播和抗中和反应中起到决定性作用。研究者对截至到2021年5月11日全球出现的主要变异株进行了系统性的回顾研究,确定了各变异株的变异位点对刺突蛋白变构、刺突蛋白与h...
以上多个突变位点在免疫缺陷患者的慢性感染中曾出现过【6-8】,免疫缺陷患者体内特殊的环境以及血浆或抗体治疗压力会导致SARS-CoV-2加速演化,进而出现一定程度的免疫逃逸,如E484K已在多项研究中被报道具有较强的免疫逃逸能力,对单克隆抗体C121、C144、2B04、2H04、1B07、REGN-10989/34等具有明显的抵抗作用,对部分...
总的来说，结果与2D的抗体滴度情况基本一致，影响最大的突变位点为417、452、484 和 501。最后为了进一步研究抗原差异的分子基础，研究人员构建了不同的 RBD 环境中的10 个在 417、452、484 和 501 位置进行单氨基酸突变的假病毒进行中和测试，结果基本与图谱预测一致。并非所有血清组对特定位置的变化都同样敏感，...
NTD是许多中和抗体靶向的抗原超位点，也被发现携带缺失，其中四个区域具有反复缺失。由于研究表明此类缺失突变会降低针对NTD的中和抗体的中和功效，因此有必要了解这些缺失在提高SARS-CoV-2的传播能力方面也可能发挥的作用。关于研究在本研究中，研究人员使用了来自世界各地的全球禽流感数据共享倡议 (GISAID) 数据库中存储...
然后，研究者通过检查 Delta-I和 Beta 突变株之间不同的 60 个位置的突变等位基因频率来计算样品中这两种变体的比率。结果显示两种变异体之间的相对丰度比率在14天内保持在1：9（Beta：Delta）。值得注意的是，在 Orf1ab 和 Spike 基因中，另外13个突变位点的比率约为 1 比 1 或 1 比 3，这些突变位点聚集...