新冠病毒(SARS-CoV-2)是一种RNA病毒,依靠表面刺突状蛋白(S蛋白)的受体结合域(RBD)与人体细胞表面的血管紧张素转化酶2(ACE2)结合,从而侵入人体细胞。在SARS-CoV-2表面,S蛋白以三聚体(三个相同的S蛋白单体组装而成)形态存在。研发疫苗是抗击新冠疫情的重要手段,其中一种思路是开发亚单位重组疫苗。其原理是:将...
根据我们的结果,同时结合已发表的结构和功能实验数据,我们推测,ACE2结合所导致的RBD稳定性的增加会将SARS-CoV-2刺突蛋白质三聚体中单个S1亚基有效地维持在站立态(或开放态),这会有利于ACE2对其它RBD的识别和结合并促使所有S1亚基的开放;另一方面,ACE2结合所导致的RBD构象转换事件很可能会促使S2'酶切位点的暴露,...
S1亚基包含一个直接与ACE2结合的受体结合位点(RBD),以及一个N末端结构域(NTD),该结构域被认为是Spike主要的功能结构域。相反,S2结构域包含两个七肽重复区(HR1和HR2)以及融合肽结构域(FP)。FP在RBD介导的Spike-ACE2相互作用后立即发挥作用,将其...
SARS-CoV-2变种的产生部分是由于病毒突刺蛋白,特别是ACE2,与受体结合域(RBD)的突变产生的。ACE2也是中和抗体的主要靶点。作者提出了一种基于机器学习的蛋白质工程技术——深度突变学习(DML)。DML能对ACE2结合和抗体逃逸的影响做出准确预测,并且能查询数十亿RBD变体组合突变的大规模序列空间。高度多样化的SARS-CoV-2...
SARS-CoV-2和SARS-CoV的基础氨基酸序列与MERS-CoV的序列存在差异，这导致病毒与不同的宿主受体结合：SARS-CoV-2和SARS-CoV结合血管紧张素转换酶2（ACE2），而MERS-CoV结合二肽基肽酶4。一种常见的感冒冠状病毒HCoVNL63也通过其RBD（S1B）结合ACE2，虽然这种作用与SARS-CoV-2和SARS-CoV的RBD-ACE2相互作用在...
与其他病毒相比,SARS-CoV-2的刺突蛋白非常灵活,可以任意掉头、摇摆、转动,对临近的细胞表面进行彻底的扫视,一旦发现结合部位(如ACE2),则利用自身的RBD与ACE2受体结合。当两者结合后,SARS-CoV-2会利用宿主蛋白酶TMPRSS2或组织蛋白酶L,TMPRSS2是呼吸道细胞表面大量存在的一种酶,剪切刺突蛋白S2亚基上的一个位点(氨...
靶向ACE2受体结合基序(RBM)的抗体通常具有较差的广度,尽管中和效力很高,但很容易通过突变逃脱。尽管如此,研究人员发现了一种有效的RBM抗体(S2E128)的特点,其广度横跨与SARS-CoV-2相关的冠状病毒,并具有很高的病毒逃逸屏障。这些数据突出了...
抗SARS-CoV-2中和单克隆抗体(mAbs)被设计用于与S蛋白的RBD或RBD-ACE2结合位点的表位发生靶向相互作用,或被选择具有强大的中和活性,但是其需要对病人每kg体重用量为4-100毫克才能达到有效治疗,储存和运输条件都较为复杂,且抵抗SARS-CoV-2变体几乎无效,特别是针对奥密克戎。因此,需要寻找一种特异性相对较低且具有更...
其与SARS-CoV-2的相似性为96.2%，仅略低于BANAL病毒，但其数量掩盖了新分离株与RaTG13之间的深刻区别。SARS-CoV-2利用其表面刺突蛋白与称为血管紧张素转换酶2（ACE2）的人类细胞受体对接并引发感染。尖峰顶端的一小部分称为受体结合域（RBD），在这一过程中起主导作用。与RaTG13上的RBD相比，BANAL的RBD序列与...
ACE2与SARS-CoV-2结合后可以引起S蛋白构象发生改变,并在跨膜丝氨酸蛋白酶2(Transmembrane serine proteinase 2,TMPRSS2)的切割作用下把S蛋白切割为S1和S2亚基,S1亚基又可进一步分为N端结构域(N terminal domain,NTD)和受体结合结构域(Receptor-binding domain,RBD),其中S2亚基可介导病毒包膜与宿主细胞膜相融合,...