41.2)将通过人源(293t细胞)表达的重组sars-cov-2 rbd蛋白(刺突糖蛋白受体结合域,即s蛋白结构域,购买自sino biological)以及通过昆虫表达的重组sars-cov-2 rbd蛋白作为适体筛选的交叉靶标。其中,将293t细胞表达的sars-cov-2 rbd蛋白修饰于protein a乳胶微球,昆虫表达的重组sars-cov-2 rbd蛋白(购买自sino biologi...
通过分析患者抗体识别的SARS-CoV-2刺突蛋白表位,发现似乎只有三个重复出现的区域与患者血清抗体结合并有效中和SARS-CoV-2,其中大多数发生在刺突蛋白的RBD之外。患者抗体识别的许多表位具有高溶剂可及度,并在RBD内经历高突变率。这一观察结果与SARS-CoV-2的RBD突变在抗体中和的免疫逃逸以及病毒进化中发挥作用的观点密切...
人SARS-CoV-2 RBD Ig 总 Simplex ProcartaPlex 试剂盒可测量血清和血浆中的抗 SARS-CoV-2 RBD 抗体。检测抗体是直接与藻红蛋白 (PE) 偶联的免疫球蛋白 (Ig) 总抗体,藻红蛋白可与血清和血浆中的所有 Ig(IgG、IgM 和 IgA)发生交叉反应。IgG 是丰度较高的免疫球蛋白。
基于此,该研究团队利用SARS-CoV-2 S2亚单位的七肽重复序列1和2(HR1和HR2)的肽可以自动组装成6-螺旋束结构特性,将包括衍生自Delta变体的RBD(320-545个氨基酸,含有L452R和T478K)序列,以及HR1(916-966个氨基酸)和HR2(1157-1203个...
还有新的证据表明,SARS-CoV-2的受体结合域(RBD)可能与已知结合血型抗原的古老凝集素家族具有序列相似性。SARS-CoV-2的RBD结合在呼吸道上皮细胞上表达A型血型,这可以解释A型血型和 SARS-CoV-2之间的联系。SARS-CoV-2的RBD结合在呼吸道上皮细...
and both SARS-CoV-1 and MERS can access this state due to the flexibility in their respective RBDs. A similar two-state structure and flexibility is found in the SARS-CoV-2 RBD (7). Based on amino acid (aa) sequence homology, the SARS-CoV-2 S1 subunit has 65% identity with SARS-...
ACE2与SARS-CoV-2结合后可以引起S蛋白构象发生改变,并在跨膜丝氨酸蛋白酶2(Transmembrane serine proteinase 2,TMPRSS2)的切割作用下把S蛋白切割为S1和S2亚基,S1亚基又可进一步分为N端结构域(N terminal domain,NTD)和受体结合结构域(Receptor-binding domain,RBD),其中S2亚基可介导病毒包膜与宿主细胞膜相融合,...
该图解释了不同SARS-CoV-2菌株在RBD区域中报告的氨基酸突变。 Fernandes Q, Inchakalody VP, Merhi M, Mestiri S, Taib N, Moustafa Abo El-Ella D, Bedhiafi T, Raza A, Al-Zaidan L, Mohsen MO, Yousuf Al-Nesf MA, Hssain AA, Yassine HM, Bachmann MF, Uddin S, Dermime S. Emerging CO...
SARS-CoV-2变种的产生部分是由于病毒突刺蛋白,特别是ACE2,与受体结合域(RBD)的突变产生的。ACE2也是中和抗体的主要靶点。作者提出了一种基于机器学习的蛋白质工程技术——深度突变学习(DML)。DML能对ACE2结合和抗体逃逸的影响做出准确预测,并且能查询数十亿RBD变体组合突变的大规模序列空间。高度多样化的SARS-CoV-2...
图3:UniBind预测SARS-CoV-2 RBD突变对ACE2和RBD抗体亲和力的影响。a:ACE2和RBD变体之间亲和度变化预测的回归,用−∆log10Kd,app测量。b:UniBind预测ACE2和RBD变体亲和度变化的外部验证。 SARS-CoV-2与中和抗体之间的预测亲和力 识别S蛋白/RBD与中和抗体之间的结合亲和力对于预测SARS-CoV-2变体的免疫逃逸至关重...