1.清华大学程功团队在期刊《Signal Transduction and Targeted Therapy》上发表了一项关于SARS-CoV-2进化预测模型的研究论文。 2.该模型名为变异进化预测语义模型(SVEP),能够结合保守规律性和非保守随机性预测SARS-CoV-2变异的序列。 3.通过输入3个不同时间点的序列数据,团队在XBB.1.16、EG.5、JN.1和BA.2.86毒株...
此外,SARS-CoV-2的另一个独特的S蛋白特征,即裂解位点,可能在人类宿主体内进化而来,可能是在疫情开始之前,通过人类种群中有限的未被检测到的循环而进化而来的。研究人员发现,SARS-CoV-2的裂解位点与禽流感病毒株的裂解位点相似,后者已被证明很容易...
SARS-CoV-2进化得对免疫的逃避更迟钝，它可能会变得类似于乙型流感。SARS-CoV-2对免疫反应的演变速度也将决定疫苗是否需要更新。进化生物学家Trevor Bedford预计，SARS-CoV-2最终将放缓至一种更稳定的变化状态，“新冠疫苗是否会像甲型H3N2流感疫苗需要每年或两年更新一次，还是每五年更新一次，或者更糟，我不太确定”...
Omicron似乎不能逃脱T细胞对其他SARS-COV-2变种的反应 T细胞在预防SARS-CoV-2中的作用已经得到了很好的证实。美国进行的一项研究报告称，几乎所有具有抗SARS-CoV-2 CD8+T细胞反应的人都能够识别Omicron变体，这表明该变体目前尚未进化出广泛的T细胞逃逸突变。有研究显示，已建立的SARS-CoV-2刺激性CD4+和CD8+T细胞对Om...
鉴于目前的研究仅根据现有病毒序列预测变异的局限性 ,团队设计了一种精细的语言模型,命名为变异进化预测语义模型(SVEP),结合组合变异的保守规律性和非保守随机性来预测即将出现的SARS-CoV-2变异的序列。它使科学界无需系统发生树、深度突变扫描(DMS)或三维蛋白质结构等信息,就能预测即将出现的SARS-CoV-2变体的序列。
SARS-CoV-2 的演变导致了变异的出现,而 Omicron 作为全球主导的次变异体是病毒进化的最新成果。这些次挥发性有机化合物的出现标志着病毒从宿主适应到免疫逃避感染和疫苗诱导的记忆反应的演变。Omicron 的不同亚型也引起了对疫苗功效的担忧,特别是其刺突(S)蛋白的变异,然而,研究表明 Omicron 主导地位可能与 S 蛋白无...
Nature重磅 | SARS-CoV-2在慢性感染治疗中的进化 截至2021年2月7日,新冠病毒累计感染超一亿多例,造成200多万人死亡。新冠病毒感染在不同患者中症状差异很大,在某些患者中仅为无症状感染、轻中度呼吸不适,危重度患者表现为急性呼吸窘迫综合征,伴随细胞因子风暴、淋巴系统减少、多器官衰竭,严重致死。然而目前研究大...
一种基于免疫和交叉中和的建模方法预测了SARS-CoV-2变异动力学,这是由一个地区的SARS-CoV-2感染史决定的。广告 X 新冠病毒在动态免疫环境中的进化研究解读 德国柏林自由大学数学系与计算机科学系的 N. Alexia Raharinirina、Nils Gubela 等研究人员在《Nature》期刊上发表了题为 “SARS-CoV-2 evolution on a ...
今天为大家介绍的是来自Shiwei Sun, Peter Pak-Hang Cheung和 Xin Gao团队的一篇与SARS-CoV-2相关的论文。SARS-CoV-2的持续演变对公共卫生构成了重大威胁。由于庞大的序列空间,了解潜在的抗原变化具有重要意义,但也具有挑战性。在这里,作者引入了机器学习引导的抗原进化预测(MLAEP)方法,它结合了结构建模、多任务学习...
鉴于目前的研究仅根据现有病毒序列预测变异的局限性 ,团队设计了一种精细的语言模型,命名为变异进化预测语义模型(SVEP),结合组合变异的保守规律性和非保守随机性来预测即将出现的SARS-CoV-2变异的序列。它使科学界无需系统发生树、深度突变扫描(DMS)或三维蛋白质结构等信息,就能预测即将出现的SARS-CoV-2变体的序列。