SARS-CoV-2是SARS-CoV的姐妹谱系,在菊头蝠宿主(Rhinophilidae家族)中发现的β-冠状病毒属(Betacoronaviruses)中Sarbecovirus亚属的一个成员,作者对所有可用的Sarbecoviruses的全基因组排列进行了重组检测分析,确定了16个重组断点,可用于将排列分割成17个假定的非重组基因组区域,可从中推断出系统发育。为了清楚地表...
目前广受关注SARS-CoV-2变体则是N501Y【1-3】,2020年10月后,SARS-CoV-2 RBD中N501Y突变突然开始大量出现,已有多项研究从多个角度阐述N501Y可以通过增强与宿主ACE2的结合力进而增强传染性,但并未出现免疫逃逸,无论是自然感染的康复患者血清,或是接种辉瑞-BioNTech疫苗的健康人血清,对N501Y的中和滴度并未降低【4-5...
SARS-CoV-2的P.1谱系,也称为20J/501Y.V3或伽马SARS-CoV-2变体,由日本国家传染病研究所首次描述,据悉于1月6日从巴西抵达日本。这种变体可以追溯到巴西的马瑙斯。人们并不认为该毒株比SARS-CoV-2的原始毒株更致命,但其传染性更强。 P.1菌株具有以下关键突变:N501Y...
在研究的最初几周,SARS-CoV-2 Alpha变异分离株主要流行,随后与SARS-CoV-2 Gamma共流行。然而,在7月下旬观察到Alpha和Gamma迅速减少,到8月初被SARS-CoV-2 Delta谱系完全取代。随后,Omicron变异株的引入在12月的3周时间内迅速取代了...
SARS-CoV-2的基因序列是使用被称为PANGO线系的全球疫情系统发育分配法(PANGO)来识别和命名的。 PANGO谱系名称使用一系列独特的字母和数字组合,例如BA.2和BA.2.12.1。世界卫生组织(WHO)外部链接免责声明使用希腊字母为关键的SARS-CoV-2变种命名,如delta和omicron。几个相关的PANGO系可能包括在一个WHO命名的变体中...
虽然记忆CD4+和CD8+ T细胞在控制SARS-CoV-2复制中的作用尚不完全清楚，但之前的研究提示，组织常驻记忆T细胞有助于长期免疫，并与预防呼吸系统疾病相关。此外，由于刺突蛋白中的T细胞表位在整个SARS-CoV-2谱系中大多保守,B/HPIV3/S- 6p对刺突蛋白特异性组织常驻记忆 CD4+和CD8+T细胞的强诱导应有利于对包括奥密克龙...
SARS-CoV-2和其他冠状病毒一样,含有具有校对活性的非结构基因。因此,这种病毒的进化比许多其他人类RNA病毒较慢,在它的大约29 kB的基因组中,每月大约发生1到2个DNA碱基替换。因此,一般只需要1～3个SNV就可以确定一种独特的病毒谱系。WA1谱系可由3个关键的SNV---C8782T、C18060T和T28144C---确定,而与圣克拉拉...
使用含有 SARS-CoV-2 刺突蛋白的 Alpha、Beta、Gamma、Delta、Epsilon、Lambda、Mu 变体或携带 D614G 的亲本病毒的假病毒进行中和试验。测试了 8 份 COVID-19 恢复期血清（B）和 10 份来自 BNT162b2 疫苗接种个体（C）的血清。每种血清的测定一式三份进行以确定 50% 中和效价，每个数据点代表用血清样品获得...
SARS-CoV-2 JN.1 变种的病毒学特征 SARS-CoV-2 BA.2.86 谱系于 2023 年 8 月首次发现,在系统发育上与目前流行的 SARS-CoV-2 Omicron XBB 谱系(包括 EG.5.1 和 HK.3)不同。与 XBB 和 BA.2 相比,BA.2.86 在刺...
通过分析与地理区域相关的SARS-CoV-2基因组，研究人员能够追溯该国不同地区新毒株之间的流入、传播和相互作用。EMBL-EBI和德国癌症研究中心的联合高级研究员和通讯作者Moritz Gerstung在一份声明中：“我们能够看到并排的谱系，及映射到特定的位置，在理解这一系列的流行病是如何展开方面具有令人难以置信的信息。”作者...