一、原始数据 otu表格:otu.txt 未全部展示,以制表符tab分隔。 物种注释表格:taxnomy.txt 未全部展示,以制表符tab分隔。 二、矩阵操作 注:除非说明,否则2至之后步骤根据1读入的数据进行修改 1.数据读入 #清除R之前的缓存 rm(list=ls()) #设置工作路径 setwd("E:/Lab/Experiment/Bioinformation/CSDN/dataframe/...
将R语言的数据框(data.frame)输出成Excel需要的格式其实也不难,我提供几种解决方案。 最简单的方法就是用write.csv或write.table将结果保存为csv格式,一般而言大部分Windows电脑都会用Excel打开csv格式。 如果对方不知道什么叫做csv格式,那么在用write.csv或write.table保存文件的时候,记得将文件后缀改为".xls"或`"...
在数据分析流程中,第一步是将数据导入,第二步往往就是对数据格式进行转换成tidy数据以便于后续分析。R语言tidyverse可以帮助我们实现这个目的。 首先导入我们相关库和数据,运用了我们在该专栏第四章介绍的数据导入、复制等技巧,不理解的小伙伴可以先看之前的文章,如果报错显示没有相关库,先使用 install.packages(‘tidy...
在R语言中,可以使用as.Date()函数来执行日期格式转换。可以将日期数据从字符串格式转换为日期格式。以下是一个示例: # 创建一个包含日期数据的向量 dates <- c("2020-01-01", "2020-02-01", "2020-03-01") # 将日期数据转换为日期格式 dates_as_date <- as.Date(dates) # 打印转换后的日期数据 pri...
同名公主号:BBio reshape2包最常用的场景就是长数据和宽数据的转换,两个函数即可搞定。作者也是tidyverse的作者,Rstudio项目的首席科学家Hadley ...
如果有了这个格式的数据可以用R语言的poppr包做主成分分分析。 公众号有读者留言问到如何将vcf格式的数据转换成 genalex格式 我查了一下找到一个链接 https://rdrr.io/github/green-striped-gecko/dartR/man/gl2genalex.html Converts a genlight object into a format suitable for input to genalex ...
牧羊的男孩儿 公众号 小明的数据分析笔记本 分享R语言数据处理可视化的内容关注 视频活动 这就是我的大学! R语言数据处理之GO注释结果的格式转换发布于 2021-05-26 09:01 · 1640 次播放 赞同添加评论 分享收藏喜欢 举报 ...
("./raster/pre_2020.nc",varname='pre') # 对栅格数据集进行栅格计算 tmp_mean = calc(tmp, fun = mean, na.rm = TRUE) * 0.1 pre_sum = calc(pre, fun = sum, na.rm = TRUE) # 裁切成同GEE获取的数据相同的范围 region = extent(103.971, 110.2772, 33.69581, 37.41483) #经度在前纬度在...
背景 在基因组学数据分析场景下,有些数据被保存为了R语言中的Seurat对象格式,我们的需求是将Seurat对象格式的数据转换为Python能处理的h5ad格式。 R处理代码 ### 1.准备工作 # 1.1 readr包安装 install.p...