处理所致倍数变化(fold change)= C(A-E)/D(F-B) 扩增效率(E)=10-1/斜率(理想的PCR扩增效率=2) 百分比表示为:e%=(E-1)×100% 同时是上面例子,如果Cdk5的扩增效率是70%;GAPDH的扩增效率是95%,那么处理所致的倍数变化(fold change)应该是 =(1.7)(25-22.1)/(1.95)(18.3-18.2) =4.36 即处理造成Cdk5...
quickQrtPCR是一款shiny app,可以根据实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)下机产生的Ct(cycle threshold:QPCR扩增过程中,扩增产物的荧光信号达到设定的荧光阈值时所对应的扩增循环数)值,计算不同样本基因的相对表达量。 这款APP如何构建 ? 基因的相对表达量计算是基于2-ΔΔCt方法;APP是基于shiny、tidyverse...
第二步，我一般将实验组减去对照组的delta ct。即得到 delta delta ct。然后再求2的- delta delta c...
quickQrtPCR是一个实用的shiny应用程序，专为实时荧光定量PCR（qRT-PCR）实验分析设计，旨在帮助科研人员快速计算不同样本中基因的相对表达量。该APP基于shiny、tidyverse和ggpubr技术构建，操作简便，只需导入包含Ct值的Excel文件，即可得到经过2-ΔΔCt方法计算出的相对表达量数据，极大地简化了实验数据处理...