近日,福建农林大学菌物研究中心在丝状真菌RT-qPCR内参基因的稳定性研究取得新成果,于2022年9月10日在Journal of Fungi(IF=5.724)发表了题目为“Genome-Wide Screening and Stability Verification of the Robust Internal Control Genes for RT-qPCR in Filamentous Fungi”的研究论文,报道了利用RNA-Seq数据鉴定到适用...
qPCR 内参基因选择——【RT-PCR技术】RT-PCR和qPCR实验内参基因选择 目录 ➢内参基因概念和作用➢内参基因的选择➢参考示例 ➢内参基因概念和作用 加内入参标即题为内部参照，内参基入因标则题是在检测目的基因从D加NA入到标题 mRNA表达过程中可用来当作参照的基因。内参基因通常是表达稳定的管家基因。➢...
根据文献和糙皮侧耳基因组数据,选择14个糙皮侧耳基因为候选内参基因,根据候选内参基因的编码序列,通过Primer premier 5软件进行RT-qPCR引物的设计,引物长为18～27 bp,产物长为80～150 bp(表1)。所需引物由浙江尚亚生物技术有限公司合成,并进行PCR试验测验其...
RT-PCR和qPCR实验内参基因选择 内参基因概念和作用 内参基因的选择 参考示例 目录 加入标题入标题加入标题 内参即为内部参照,内参基因则是在检测目的基因从DNA到 mRNA表达过程中可用来当作参照的基因。内参基因通常是表 达稳定的管家基因。 内参基因概念和作用 内参基因的作用 为了避免检测样本在RNA产量、质量 和反转录...
1.2.2 候选内参基因的 RT-qPCR 分析根据 FinePure Plant RNA 提取试剂盒说明书提取无患子 样品的总 RNA,并采用 1% 琼脂糖凝胶电泳检测每 个样品的 RNA 质量,然后使用 NanoDrop 2000 分光 光度计检测 RNA 的浓度及纯度, 要求 A260/A280 值在 1.8-2.1 之间.使用反转录试剂盒 Goldenstar RT6 cDNA Synthesis ...
近日,福建农林大学菌物研究中心在丝状真菌RT-qPCR内参基因的稳定性研究取得新成果,于2022年9月10日在Journal of Fungi(IF=5.724)发表了题目为“Genome-Wide Screening and Stability Verification of the Robust Internal Control Genes for RT-qPCR in Filamentous Fungi”的研究论文,报道了利用RNA-Seq数据鉴定到适用...
表达的内参基因用于基因定量表达分析,以模拟接种和接种葱鳞葡萄孢菌 24,48,72 h 的韭菜叶片为材料,基于前期的转 录组测序结果选取 UBC1,UBC2,UBQ1,UBQ2,GAPDH3,GAPDH4,TUB,EF-1α,40S RP,DDX,eIF-1A,PABP 和 DnaJ 共 13 个基因为候选内参基因,利用实时荧光定量 PCR(RT-qPCR)技术检测 13 个基因的...
扌摘要：目的筛选适于在大动脉炎（TAK ）患者和健康人群（HC ）之间比较外周血单个核细胞（PBMC ）中mRNA 表达 水平的内参基因。方法提取PBMC 中的总RNA,应用RT-qPCR ，分别采用geNorm 、NormFinder 、BestKeeper 3种软 件程序，分析 3-glucuronidase ,GAPDH ,ACTB ,SDHA ,HPRT1,RPL13A ,B2M , YWHAZ 和 PKG...
通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测这些候选内参基因的表达量,并利用geNorm、NormFider和BestKeeper三个软件及RefFinder在线分析工具评价候选内参基因的稳定性。结果表明,8个候选内参基因的表达量在所有样本间的变化幅度存在差异;geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个软件筛选出的最佳内参基因略有不同;综合分析结果表明SmACT、...
大多数传统内参基因已不能满足RT-qPCR准确定量的要求。本研究分析了在四种不同逆境条件下大豆中9个内参基因ACTll、TUA5、CYP、EFlB、TUA4、TUB4、EFlA、ACT2/7和UKN2的表达稳定性。结果表明:EFlA和ACTll在盐胁迫下表达稳定;TUB4、TUA5和EFlA在干旱处理时表达稳定;ACTll和UKN2在黑暗(衰老)处理时表达稳定;EF...