IDT-qPCR primer design Fig2 IDT在线引物设计工具页面 Fig3 结果页面展示 lncRNA引物设计: lncRNA:和mRNA的步骤一致。 miRNA:茎环法原理:由于miRNA全部为23nt左右的短序列,无法进行直接PCR检测,所以使用了茎环序列这个工具,茎环序列是一段50nt左右单链DNA,可以自身形成发卡结构,3’末端可以设计成与miRNA部分片段互...
与传统的RT-qPCR(实时定量聚合酶链式反应)相比,WGS能够提供病毒的全基因组信息,这对于病毒的分类、进化分析以及新病毒的发现具有不可替代的优势。通过与RT-qPCR结果的结合,WGS能够对初步检测到的病毒进行确认,确保检测结果的准确性。 应用案例 在一项针对冷冻浆果的检测中,科研人员首先利用RT-qPCR快速筛查出可能含有食...
保存384板结果为csv 个人习惯每次做两个复孔,上下为同一孔,每个引物占两行 每次可运行8个引物,每个引物总样本量最大为24 数据示例: image.png 代码语言:text 复制 rm(list = ls()) #!!!修改参数!!! dat <- read.csv(file = "ct_value_2.csv",header = F) #文件名 gene_list <- c("ACTIN","...
常用的方法是2^-△△Ct方法计算。Cq=Ct,两者是一个 意思。 本文主要讲述内容: 2^-△△Ct的计算方法 参考资料: 1 文献 2-△△Ct=2-[(处理组Cq-内参cq)-(对照组Cq-内参Cq)] 详细公式原理,可以看参考链接和参考文献。 当具有多个生物学和技术重复时,先单独求,之后求平均值。
5、RT-qPCR验证差异表达miRNA 选择十六个差异表达的miRNA,通过RT-qPCR验证miRNA测序结果的可靠性。分析结果如图6所示:miR-200b、miR-103、miR-107、miR-148a、miR-30b、miR-30d、miR-200a、let-7b、miR-30a-3p和miR-30a-5p在空杯期绵羊乳腺组织中的表达比在泌乳高峰期中低。然而,miR-125b、miR-493-5p、mi...
qPCR实验灵敏度非常高,一个条件的不同就可能导致实验结果发生改变。为了增加实验可靠性、重复性,按照同一标准对实验条件进行描述就很有必要了。MIQE就是这一国际化标准。 2009年,Stephen A等人发表文章《The MIQE Guidelines:Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments》,文中规定了...
常用的方法是2^-△△Ct方法计算。Cq=Ct,两者是一个 意思。本文主要讲述内容：
qPCR检测用于体外诊断中要保证检测结果的可靠性和准确性,这对诊断的判断和采取及时的治疗措施非常重要。 比如说在新冠刚爆发初期,RT-qPCR检测假阴性的问题一度比较受关注,有一些阳性检出率甚至低于50%,这在重大传染性疾病防控中造成的影响是至关重大的。
首先介绍一下背景:我做的是人群,分为暴露人群和对照人群,然后采集其外周血取淋巴细胞测相关基因的表达。RT-qPCR得到的结果包括Ct,ΔCt。由于暴露人群和对照人群只是大体的分组,并未进行一一配对,所以无法得到ΔΔCt,所以