标准曲线还包括R2值,用于测量重复样本的可重复性。重复标准曲线以评估一致性,从而保持样本的数据准确度。四、RT-qPCR四方面常见困难 RT-qPCR的常见困难可归结为四个主要方面:引物二聚体的形成、引物和探针的储存、实时荧光定量 PCR的抑制和较低的反应效率、软件分析设置。图6:实时荧光定量PCR常见四方面困难 RT-q...
标准曲线还包括R2值,用于测量重复样本的可重复性。重复标准曲线以评估一致性,从而保持样本的数据准确度。 四、RT-qPCR四方面常见困难 RT-qPCR的常见困难可归结为四个主要方面:引物二聚体的形成、引物和探针的储存、实时荧光定量 PCR的抑制和较低的反应效率、软件分析设置。 图6:实时荧光定量PCR常见四方面困难 RT-q...
效率在90–110%的理想窗口内的标准曲线确定了RT-qPCR反应可测量的起始模板量范围。某种程度上可通过靶点Ct在扩增曲线上出现的时间测定灵敏度。 但是,分析灵敏度的实际测量方法是特定少量的模板是否适用于标准曲线并维持理想的扩增效率。符合要...
图7.qPCR的数学原理和标准曲线图 从线性方程可以看出,lg(N初始模板量)与Ct值呈负线性关系,即模板拷贝数越多,其Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准样品绘制标准曲线,根据荧光基团发出的荧光强度与PCR 扩增产物的数量呈对应关系,只要对荧光信号进行实时监测并得到未知样品的Ct值,即可通过标准曲线计算未知样品的起...
④ qPCR 反应结束后,以模板系列稀释倍数 log 值为 X 轴,以对应的 Ct 值为 Y 轴(反之亦可),制作标准曲线,如下图。 图3.标准曲线 当扩增效率 E 应在 90~110% 之间(根据E=10-1/斜率–1 公式计算,对应的斜率范围应在 -3.1~-3.58之间),标准曲线 R2...
曲线表示从STD01到STD07的标准样品(对应浓度如右图所示);右图是RT-qPCR定量标准曲线。X轴从右到左表示STD01-STD07样品浓度(pg/mL);Y轴为qPCR循环ct值。图B为bDNA定量标准曲线,X轴从左到右代表STD01-STD08样品浓度 批内/批间准确度和精密度 如图4所示,评估RT-qPCR和bDNA方法时,每个run都有1组标准样品(...
▲图4:标准曲线,图源:Azure Cielo™ qPCR系统 6、内参基因的选择 在RT-qPCR实验中,内参基因可以用于校正上样量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。一个好的内参基因应在不同时空样本或不同处理样本中具有相对稳定的表达水平,常见的有ATCB、GAPDH、β-actin、18S rRNA等。
1.标准曲线法: a.将cDNA混合 b.梯度稀释 c.qPCR d.线性回归方程计算扩增效率 2.LinRegPCR LinRegPCR is a program for the analysis of real time RT-PCR Data,also called quantitative PCR(qPCR)data based on SYBR Green or similar chemistry. The program uses non-baseline corrected data,performs a ...
图1.基线、标准偏差和荧光阈值示意图 一、荧光标记方法 RT-qPCR是通过检测反应体系中的荧光强度来检测PCR扩增产物的,其荧光标记方法分为两种:荧光染料嵌合法和荧光探针法。1.荧光染料嵌合法 荧光染料嵌合法即应用一种带有荧光的、非特异的DNA结合染料检测PCR过程中积累的扩增产物。常用SYBR Green I染料,该染料在...
实时荧光定量PCR(RT-qPCR) 原理 在PCR反应体系中加入荧光基因,利用荧光信号累计实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。 特点 检测仪器少,只用一台仪器。 检测时间短,只须45分钟~1小时10分钟(试剂各异),而定性PCR须3~4小时,酶免终点定量须6~8小时,荧光终点定量须2~3小时。