rsession-ld-library-path=/home/myubuntu/.conda/envs/r413/lib 但是,此时在网页版的RStudio中的console中直接执行install.packages安装所需要的R包时,往往会执行失败(提示无法找到make),但是在terminal中,切换到对于的conda环境下,进入R后再执行install.packages就会成功。 网上的教程,往往都是让进入conda环境的R...
于是换成conda安装R包,但是提示还是安装失败了,猜测主要原因可能是安装R包的环境比较杂,因为之前已经在这里面安装了一些软件,于是重新创建了一个新的环境,使用如下命令安装Seurat: #使用conda安装R包 conda install r-seurat #进入R R #加载Seurat观察安装R包是否成功 library(Seurat) 加载Seurat包后,会出现两行提示...
sudo gdebi rstudio-server-1.4.1103-amd64.deb 1. 2. 3. 4. 默认是自己启动,Rstudio的默认端口是 8787 我之前在R里安装R包,直接就是install.packages("packagesname") 这次我安装ggplot2的时候 install.packages("ggplot2") 1. 他只安装ggplot2这一个包,其他的就不安装,所以就会失败 在命令里多加两个参...
重启Rstudio-server sudo rstudio-server status #查看RStudio-server sudo rstudio-server stop #关闭RStudio-server sudo rstudio-server restart #重启RStudio-server 1. 2. 3. 重启之后,打开Rstudio-server,发现R版本已经变为R4.1.0了,搞定! 7. 在conda环境中安装R包 R4.1.0 if (!requireNamespace("B...
安装rstudio server后,配置完成,其他组内用户都可登录,唯独我自己账号失败,找了好久原因。 查看日志文件:/var/log/rstudio/rstudio-server/rserver.log 根据关键信息搜索得知,rstudio server默认不允许用户id小于1000的系统账号登录。 id username 命令查看自己用户id,一看果然小于1000。
在rstudio-server中安装swirl包 试图在rstudio-server中安装swirl 前提已确保最新版本R install.packages("swirl") 期间各种尝试,结果发现直接 sudo apt install libcurl4-openssl-dev //Ubuntun手动安装curl-config install.packages("swirl") 其实error:configuration failed for package "openssl" 以及checking for ...
1. 安装软件包 CentOS 7: 执行相应的命令安装Rstudio-server所需的基础包。CentOS 8: 请确保您的系统已更新至最新版本，然后按照官方文档安装。2. 开放访问权限 为了通过网络访问Rstudio-server，需要在防火墙中开放8787端口。在CentOS 7和8中，分别执行:CentOS 7: sudo firewall-cmd --permanent --...
1. 安装BLAS和LAPACK library 首先非常感谢参考文章(前两步都是参考这篇文章)inferCNV centos服务器安装失败解决 - 简书 (jianshu.com), 过程如下: sudo yum install blas-devel lapack-devel 2.安装JAGS 下载JAGS安装包 wget https://ftp.debian.org/debian/pool/main/j/jags/jags_4.3.2.orig.tar.gz ...
sudo rstudio-server status #查看RStudio-server sudo rstudio-server stop #关闭RStudio-server sudo rstudio-server restart #重启RStudio-server 2.3 安装必备的系统库文件 R包安装失败通常是Linux的库文件缺失,自行搜索安装必备的系统库文件 ,安装走一波: ...