老旧的CentOS 7,Rstudio-server version 1.0.136 确认R的位置 在你喜欢的conda环境里用 which R 把这个复制下来,这是你conda的R的位置 2. 在 /etc/rstudio/rserver.conf 里,加入: rsession-which-r=/opt/miniconda3/envs/R_4.4./bin/R rsession-ld-library-path=/opt/miniconda3/envs/R_4.4./lib ...
重新启动 RStudio Server 后,登录到 RStudio Server 界面,并在控制台中运行: sessionInfo() 这应该显示你的 R 版本为 4.1.3,表明你现在正在使用monocle3环境中的 R。 如果你按照你上步骤成功的在rstudio-server里面切换了,不同conda虚拟环境中的R。 那么恭喜你! 但是!,如果你已经做完了以上的所有操作,但是依...
再次运行Rstudio-server,搞定! 9. 其它人用Rstudio-server安装R包 因为现在Rstudio-server用的是conda环境中的R4.1,它会在conda环境中有一个library,普通用户没有写入的权限,安装R包时会在自己的路径下自动新建一个library。如果安装包出错,就进入conda的环境,安装即可,绝对可以成功。 特别好使! 10. 总结 1,cond...
1. 查看特定Conda环境中R package library的位置 a. 在Linux Shell中激活特定Conda环境 b. 启动R c. 在R中使用.libPaths()来查看当前环境中R package的安装位置 2. 对RStudio server使用的R package library进行重新设定 a. 在RStudio server中用.libPaths("path")来指定R package library 在Linux Shell中查看...
实现方式 2:使用 conda 安装 R 包并配置 libpath # 使用 conda 安装指定版本的 R 包 ## 创建 conda 环境 conda create -n r-reticulate r-uwot==0.1.11 -y conda activate r-reticulate # 配置 libpath .libPaths(c("/home/txb/miniconda3/envs/r-reticulate/lib/R/library", .libPaths())) ...
以下是使用 Conda 安装 RStudio Server 的步骤,我们用一个表格来展示这些步骤: 每一步详细操作 1. 创建 Conda 环境 首先,我们需要创建一个新的 Conda 环境以保持依赖关系的干净与独立。 conda create-nr_env r-essentials 1. conda create是 Conda 生成新环境的命令。
R4.0的安装借助于conda,并创建R4的环境安装4.0的R包,参考《遇到不省心的Rstudio Server安装R包总是失败怎么办?》—— 豆豆花花 生信星球 https://www.jieandze1314.com/post/cnposts/243/ 1. 服务器的申请与配置 添加新的用户名并赋予sudo权限:
conda_create("r-reticulate")conda_install("r-reticulate","scipy") 当然我们也可以直接在所在的python 环境内直接安装: 代码语言:javascript 复制 py_install("pandas") 1. 直接在R 中运行python 模块与函数 reticulate 包非常牛X 的一点是,它允许我们使用R 风格的代码来运行python。
# 例如我这里有一个conda环境中的R rsession-which-r=/home/biomamba/miniconda3/envs/monocle.2.18.0/bin/R # 重启生效: sudo rstudio-server restart 不想用Vim编辑器也可以这么操作: # 修改配置文件: echo 'rsession-which-r=/home/biomamba/anaconda3/bin/R' >> /etc/rstudio/rserver.conf ...
RStudio-Server是R最常用的集成开发环境（IDE，Integrated Development Environment )，RStudio-Server相对于RStudio来说，用于页面登录，有着一定的安全性和便捷性，也是Ubuntu系统常用的R软件。1.安装R 直接在Ubuntu环境下安装，先不讲conda环境下的安装。常见的安装方式就是官网上搜索如下安装途径和命令。r...