整理数据并导入MedCale可以将SPSS中的数据直接复制到MedCale中,在最上面一行填写变量名称;或者原始数据在Excel中,可以用MedCalec直接打开Excel文件。数据说明:A列gold是金标准判断规则,1是阳性,0是阴性。B列method1代表使用新方法诊断的连续变量,目的是绘制新方法1的ROC曲线并找到最佳截断值cut-off值。执行操作...
第一步,在SPSS输出界面复制曲线坐标。 第二步,粘贴到excel中,首先,删掉前三行和后两行有文字的内容,然后插入标题行:cut off、se、1-sp、Youden’s index、Euclidean’s index、product index。 通过公式编辑和填充即可知道不同界值对应的三个index指标。比如,通过Euclidean...
Youden指数依据ROC指标体系中的敏感度、特异度来获得,最佳切点算法还可以“closest.topleft”,具体产生过程和指标概念见表2、表3。其中灵敏度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值是除了AUC外最常用的5个ROC评价指标。ROC自动切点除了pROC外有OptimalCutpoints、Epi包,但是笔者测试后面2个有bug,结果有时候会不够...
确定cut-off值时,我们一般将SPSS结果复制到excel中,计算kappa值=敏感度-1-特异度即可,然后筛选-排序即可得出。大优指标正常操作即可,但小优指标则需要用预测概率或者差值或者倒数,再找到指标1的原始结果。当然还有更简单的办法,就是单独做一次小优指标ROC曲线分析,也可以直接得出具体cut-off值。 三、大小优指标同时存...
SPSS中的ROC曲线分析详解ROC曲线,作为评估诊断方法效力的重要工具,其曲线下面积越高,代表方法的诊断价值越高。让我们通过实际操作来理解其在数据分析中的应用,包括cutoff值选择和性能指标评估。首先,进入SPSS,选择【分析】>【ROC曲线图】,将‘AFP’浓度测值导入【检验变量】,并将‘status’标记为【...
1.数据录入:Medcalc的界面与SPSS相似,但是没有变量视图。我们可以将SPSS中的数据直接复制到Medcalc中,...
我们在前面学习过用SPSS(SPSS操作:多项测量指标的ROC曲线分析)和Stata (Stata教程:ROC曲线下面积的比较)绘制ROC曲线。但是,最佳临界点--截断值(cut-off point),该怎么选取呢? 今天我们来讲一下如何用SPSS和Medcalc来绘制ROC曲线,并找到截断值。 假设某实验室人员选用一种新方法对同一批患者进行了诊断,患者的真实...
数据-ROC曲线1: X:连续变量 group: 1/0 操作:分析-ROC曲线 图-X检验变量 group状态变量,状态变量值=1(1有病 0没病)-勾上如图选项 选项-默认-if曲线在参考值下面then改变检验方向 正1 负 0 ROC曲线:在参考线上面 纵坐标 横坐标i= AUC:面积图 标准错误(标准差?) P值(小于0.01 具有统计学意义)95%置...
区域大于0.7就是比较好了,当然太大就要怀疑一下了,比如0.9以上,过于优秀了,p值一样的要小于0.05。 数据量小时线不是那么平滑,可以双击曲线,add interdependent line→spline→apply,然后选中原线条按delete 这里就是cutoff值了,第一列和第二列差值最大值对应的变量为cutoff值 ...
通常情况下,SCI杂志会要求我们计算诊断实验中的最佳切割点,cutoff值,而SPSS恰好不能提供。R软件是一款统计功能十分强大的开源软件,OptimalCutpoints包是一个专门做ROC曲线和cutoff值的包,利用R软件可以轻松实现。不想写命令的可以使用基于OptimalCutpoints包的网页工具即可。