近日,西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室赵盖超博士等为第一作者,西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室崔红娟教授和广西医科大学Liping Zhong为共同通讯,揭示了在胃癌(GC)中,RNA结合蛋白NONO通过m5C修饰和可变剪切(AS)调控PTEN mRNA表达,进而影响胃癌进展。研究通过分析m5C RNA甲基化测序(RNA-BS)、...
近日,研究人员在Blood杂志上发表研究成果,揭示m5C修饰及其结合蛋白Ybx1在调控HSPC扩增中的作用,为优化体外HSPC扩增策略提供新视角。 研究人员首先通过RNA亚硫酸氢盐测序(RNA-BisSeq)系统绘制了斑马鱼HSPC在AGM、CHT及KM三个发育阶段的m5C修饰...
RNA修饰指在RNA分子上发生的化学变化,这些变化不涉及RNA序列改变,而是通过添加或去除某些化学基团来改变RNA分子的性质。甲基化修饰是最常见的RNA修饰之一,包括m6A、m5C、m1A、m7G等,参与RNA稳定性、定位、剪接、翻译以及降解等过程。 02.技术优势 03. 典型案例 案例1:m5C项目案例:RCMS编辑系统在特定细胞RNA位点的靶向...
m5C甲基化发生在胞嘧啶残基的第5位,是DNA和RNA共有的一种修饰。自1958年被鉴定以来,m5C被描述为在tRNA、rRNA、mRNA、增强子RNA(eRNA)和miRNA中广泛存在的表观转录组标记,尤其在真核生物的tRNA和rRNA中含量最丰富(图1)。 在真核生物中,m5C甲基化由NOL1/NOP2/SUN结构域(NSUN)家族成员、NSUN1-7和DNA甲基转移...
近年来,RNA表观遗传修饰(如5-甲基胞嘧啶,m5C)被证实参与调控mRNA稳定性、出核运输等关键过程,尤其在胚胎发育等需要快速转录转换的场景中发挥重要作用。然而,m5C在HSPC发育中的动态修饰模式及其调控机制仍属空白。近日,研究人员在Blood杂志上...
5-甲基胞嘧啶(m5C)是一种在转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)中广泛存在的核酸修饰,同时也在转录组中广泛分布,是真核生物信使RNA(mRNA)的内部修饰之一。越来越多的证据证实了m5C在mRNA中的存在。随着检测技术的进步,尤其是亚硫酸盐测序(bisulfite sequencing)的应用,m5C修饰在转录组中的分布和功能逐渐被揭示,人们对...
RNA-蛋白Pull-Down实验显示NONO蛋白与PTEN mRNA之间的相互作用。 通过RIP-qPCR检测GC细胞裂解液中不同PTEN mRNA种类与NONO蛋白之间的相互作用(n=3)。 (3)PTEN pre-mRNA的m5C模式受NONO介导的NSUN2招募影响 RNA-BS分析发现,NONO敲低导致PTEN mRNA的m5C修饰水平显著降低,表明NONO通过NSUN2影响PTEN mRNA的m5C修饰。
RNA-BisSeq(RNA-BS):用于分析m5C修饰模式的变化,通过RNA-BS测序技术,研究NONO对PTEN mRNA m5C修饰的影响。 免疫共沉淀与RNA免疫沉淀:验证NONO与NSUN2的相互作用,以及它们对PTEN mRNA的结合情况。 Minigene报告基因分析:通过构建包含PTEN外显子5、内含子5和外显子6的Minigene报告基因,研究NONO对PTEN可变剪切的影响。
🌐在表观遗传学的广阔领域中,RNA修饰以其丰富多样性的特点,吸引了众多科研工作者的目光。除了广为人知的m6A修饰外,m5C修饰同样值得深入探索。📚目前,学术界对m5C修饰的研究尚处于起步阶段,但其潜力和价值已逐渐显现。通过研究m5C修饰,我们能够更好地理解RNA的稳定性、定位和功能等方面的复杂机制。💡...
RNA修饰是近几年表观转录组学的热门,迄今已发现了170多种RNA化学修饰,调节了多种RNA功能,如剪切、稳定性、结构、翻译等。 当前,研究者多以测序确认分子有无发生RNA修饰,但无法直接证明,细胞功能的变化与对应分子有直接关联,这为研究的进一步展开提出了痛点。得益于分子生物学的发展,尤其是CRISPR的出现,这一问题得以...