使⽤R从RNA-seq数据绘制热图代码 ⽂/伍鸿荣 要做热图,⾸先我们是要准备好数据,⽐如说TCGA的rna-seq,或者你⾃个测有的数据。然后可能利⽤deseq 包进⾏差异分析。⽐如说作者提出的⽤阿扎胞苷对AML3细胞影响的基因表达谱数据。数据筛选:在热图上绘制所有5704个FDR调整p值<> 1. Read the ...
要做热图,首先我们是要准备好数据,比如说TCGA的rna-seq,或者你自个测有的数据。然后可能利用deseq 包进行差异分析。比如说作者提出的用阿扎胞苷对AML3细胞影响的基因表达谱数据。 数据筛选:在热图上绘制所有5704个FDR调整p值<> Read the count matrix and DESeq table into R and merge into one table Sort b...