文库检测合格后,把不同文库按照有效浓度及目标下机数据量的需求pooling后在illumina Nova平台测序,测序策略为PE150。 三、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)信息分析流程 (一)原始下机数据质控 原始下机数据为FASTQ格式,是高通量测序的标准格式。FASTQ文件每四行为一个单位,包含一条测序序列(read)的信息。该...
3. 液滴可回收,接驳单液滴分选仪,后续用于测序或目标基因检测。
二、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验流程 确保高质量数据产出，每一步操作都需严格把控。从样品处理到最终数据获得，包括Total RNA样品检测、文库构建、文库质检和上机测序等关键步骤。三、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)信息分析流程 原始下机数据需进行质控、数据比对、m6A修饰区...
MeRIP-seq将RNA上发生m6A修饰的区域富集后进行测序,因此发生m6A修饰的区域,IP文库所覆盖的reads数会显著高于input文库,从而形成“峰(peak)”。检测这些峰的位置即可得到RNA上发生m6A修饰的位置。 鉴定得到m6A修饰后,再对m6A修饰进行注释、分布统计、moti...
三、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)信息分析流程 (一)原始下机数据质控 原始下机数据为FASTQ格式,是高通量测序的标准格式。FASTQ文件每四行为一个单位,包含一条测序序列(read)的信息。该单位第一行为read的ID,一般以@符号开头;第二行为测序的序列,也就是reads的序列;第三行一般是一个+号,或者与第一...
三、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)信息分析流程 (一)原始下机数据质控 原始下机数据为FASTQ格式,是高通量测序的标准格式。FASTQ文件每四行为一个单位,包含一条测序序列(read)的信息。该单位第一行为read的ID,一般以@符号开头;第二行为测序的序列,也就是reads的序列;第三行一般是一个+号,或者与第一...
三、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)信息分析流程 (一)原始下机数据质控 原始下机数据为FASTQ格式,是高通量测序的标准格式。FASTQ文件每四行为一个单位,包含一条测序序列(read)的信息。该单位第一行为read的ID,一般以@符号开头;第二行为测序的序列,也就是reads的序列;第三行一般是一个+号,或者与第一...
三、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)信息分析流程 (一)原始下机数据质控 原始下机数据为FASTQ格式,是高通量测序的标准格式。FASTQ文件每四行为一个单位,包含一条测序序列(read)的信息。该单位第一行为read的ID,一般以@符号开头;第二行为测序的序列,也就是reads的序列;第三行一般是一个+号,或者与第一...
二、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验流程 从样品处理到最终数据获得中每一个环节都会对数据质量和数量产生影响,而数据质量又会直接影响后续信息分析的结果。为了从源头上保证测序数据的准确性、可靠性,需对样品处理、建库、测序每一个生成步骤都严格把控,从根本上保证了高质量数据的产出。流程图如下: ...