library(NbClust) # 读入数据 data = read.table("T_405_ex.txt",header = T, row.names = 1) b = matrix(data, nrow = 1, ncol = 1) new<-as.matrix(t(data)) is.matrix(new) #标准化 my_data <- na.omit(new) my_data <- scale(my_data) head(my_data, n = 3) get_clust_tende...
通过RNA-seq技术,我们可以获得大量关于基因表达的定量信息,从而更深入地理解乳腺发育的分子机制。 在乳腺发育过程中,促生存基因Mcl1被认为是关键的调控因子之一。为了更全面地揭示Mcl1在乳腺发育中的调控作用,本研究帮助客户采用层次聚类和多维缩放(MDS)等方法对RNA-seq数据进行深入分析。层次聚类可以帮助我们识别不同样本...
晶能特别定制疫情期间自我提升指南之“单细胞RNA-seq数据分析系列专题课”今天下午14点准时开播,由晶能生物生信分析工程师张腾娇带来《单细胞RNA-seq数据分析1——降维与聚类》。 课程简介 本期主题是单细胞RNA-seq数据的降维与聚类。课程内容包括利用Seur...
中图分类号:TP391论文编号:10871618-S09学科分类号:08100硕士学位论文RNA-Seq数据差异表达及聚类分析研究研究生姓名石险峰学科专业计算机科学与技术研究方向智能计算与机器学习指导教师刘学军教授南京航空航天大学研究生院计算机科学与技术学院二О一八年三月万方数据
理学硕士学位论文RNA.Seq系列数据共表达基因聚类分析硕士研究生:导师:专业:方向:院系:赵辉李霞教授生物医学工程生物信息学生物信息科学与技术学院DissertationfortheDegreeofMasterofScienceGeneco-expressionpatternclassificationofSeriesCandidate:ZhaoHuiSupervisor:Major:ResearchDirection:A—SeqdataProf.LiXiabiomedicalengineeringBi...
拟时间轨迹推断是single-cell RNA-seq数据的一个重要任务,一般用聚类算法去分析。()A.正确B.错误
为了更全面地揭示Mcl1在乳腺发育中的调控作用,本研究帮助客户采用层次聚类和多维缩放(MDS)等方法对RNA-seq数据进行深入分析。层次聚类可以帮助我们识别不同样本之间的相似性和差异性,从而揭示乳腺发育过程中不同阶段的基因表达模式。而MDS则可以将高维的基因表达数据转化为低维空间中的点,便于我们进行可视化和模式识别。
为了更全面地揭示Mcl1在乳腺发育中的调控作用,本研究帮助客户采用层次聚类和多维缩放(MDS)等方法对RNA-seq数据进行深入分析。层次聚类可以帮助我们识别不同样本之间的相似性和差异性,从而揭示乳腺发育过程中不同阶段的基因表达模式。而MDS则可以将高维的基因表达数据转化为低维空间中的点,便于我们进行可视化和模式识别。