差异基因表达测试通常会返回每个比较条件下每个比较基因的log2倍数变化和调整后的p值。然后可以按p值对该列表进行排序并进行更详细的研究。 流行的学生t检验是进行此类检验的一种方法。然而,它没有考虑到一些单细胞RNA-seq的特殊性,例如来自dropout的过多零或需要复杂的实验设计。更具体地说,在不汇集跨基因信息的情...
linux分析部分详见RNA-seq分析流程(一)https://www.jianshu.com/p/e8a0be4121b1 rm(list=ls())if(!require(DESeq2))BiocManager::install("DESeq2")library(rio)library(dplyr)Gene=import("seed_gene_list.csv",header=T)#构造数据库,前面是处理,后面是对照database=Gene[,c(21:23,13:15)]#test,co...
差异基因表达的RNA-seq数据分析流程。 #玖科医学生物#提升临床医学科研能力#推动医学科研高质发展