RNA-Seq归一化算法的意义: 基因表达量归一化:在高通量测序过程中,样品间在数据总量、基因长度、基因数目、高表达基因分布甚至同一个基因的不同转录本分布上存在差别。因此不能直接比较表达量,必须将数据进行归一化处理。 RNA-seq差异表达分析的一般原则 1)不同样品的基因总表达量相似 2)上调差异表达与下调差异表达...
RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析 差异分析的步骤:1)⽐对;2) read count计算;3) read count的归⼀化;4)差异表达分析;背景知识:1)⽐对:普通⽐对: BWA,SOAP 开⼤GAP⽐对:Tophat(Bowtie2);2) Read count(多重⽐对的问题):丢弃 平均分配 利⽤Unique region估计并重新...
内容提示: RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析基迪奥 培训组1 文档格式:PDF | 页数:62 | 浏览次数:753 | 上传日期:2017-02-12 00:16:38 | 文档星级: RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析基迪奥 培训组1 阅读了该文档的用户还阅读了这些文档 140 p. 中小型水利水电工程地质勘察规范(SL55-...