综上所述,RNA-Seq在技术原理、动态范围与灵敏度、检测能力与准确性、数据重分析与可扩展性以及应用前景与影响力等方面均表现出相对于基因芯片的优势。这些优势使得RNA-Seq成为当前转录组学研究的重要工具之一。
RNA-seq 可以揭示未知的转录本、基因融合和遗传多态性，而芯片只能检出明确的已知目标。在测序深度足够的情况下，RNA-seq 在高丰度和低丰度转录本检测中都比芯片有效。不过由于芯片可以快速分析大量样本，该技术在这方面还将继续占据统治地位，FDA 国家毒理学研究中心的 Weida Tong 指出。不过，科学研究最终将完全转向 ...
因此,研究表明,RNA-Seq可检测的差异表达基因比例比表达芯片更高,特别是低丰度的基因4,5。 索取Illumina的RNA-Seq 相关技术手册 检测选择性剪接位点和新型异构体以及非编码RNA的能力 除了基因表达谱分析,RNA-Seq还能鉴定选择性剪接异构体、剪接位点和等位基因特异的表达–所有这些都在单个实验中完成1,2。此外,RNA-Seq...
RNA-seq在测表达量的同时还可以发现突变,基因芯片不能。 基因芯片(这里专指测RNA的表达谱芯片)确实不能发现突变。RNA-seq是通过测序来检测RNA丰度的,确实可以获得序列信息,但是因为测序本身有错误率,而RNA-seq常做的测序深度很低,得到的突变信息其实并不准确。要想准确,就需要极高的测序深度,那么又回到老问题了,...
尽管RNA-seq有那么多的优点,大家对芯片仍是情有独钟。那是因为,相比较于RNA-seq,芯片技术更加成熟,尤其是样本量比较大的研究。芯片在临床研究中也很吃香,因为它的数据处理又快又简单。芯片能提供高度一致的数据,分析软件也相当成熟。通过分析成百上千的样本,基因和...
RNA-seq技术的特点 RNA-seq对芯片的优势 RNA-seq检测基因表达主要在7个方面比基因芯片有优势。 RNA-seq存在的问题 RNA-seq测序之前需要一个比较复杂的文库构建过程,这个过程的每一步都可能带来误差甚至导致实验失败。如cDNA片段化、PCR扩增等都会带来偏倚,最终导致有的片段被反复测了多次,有的没有测到。rRNA去除不...
RNA-seq的广泛应用促进了对许多生物层面的理解,如揭示了mRNA剪接的复杂性、非编码RNA和增强子RNA调控基因表达的机制。RNA-seq的发展和进步一直离不开技术发展的支持(湿实验方面和计算分析方面),且与先前的基于基因芯片的技术比起来,获得的信息更多、偏好性更小。到目前为止,已从标准的RNA-seq流程中衍生出多达100种不...
前面我们介绍了表达量研究领域的,基因芯片和RNA-seq测序技术,并且把详细的学习资料和视频教程免费共享在了B站。 有学员提出来了一个问题,就是可以比较 同样实验设计的表达量探索研究,一个研究使用的是芯片,一…
RNA-seq是比基因芯片更先进的技术，其优势这里不多说了。既然它更先进，那么肯定是首选的技术。目前普遍...
RNA-seq的更广泛应用已经促进了我们对生物学多方面的理解 ,例如通过提示mRNA剪接和非编码RNAs和增强子RNAs对基因表达的调控。RNA-seq的应用和进步是由技术发展(湿实验室和计算生物学)驱动的,相对于以前的基因芯片,RNA-seq这种方法对RNA生物学和转录组产生更丰富并且偏见更小的信息。到目前为止,从标准的RNA-seq方法...