转录组测序(RNA-Seq,RNA sequencing)是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物(包括mRNA、非编码RNA等)进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络,是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
在 RNAseq 测序中,我们需要的恰恰就是这 5%的区域。 除了传统的 mRNAseq 测序,目前又逐渐开发除了其他非编码 RNA 的测序,包括长链非编码RNA(LncRNA) 测序,小 RNA (Small RNA),环状 RNA(circRNA)以及全转录组测序,单细胞转录组测序,转录调控因子测序,蛋白质组学测序,代谢组学测序等。 二、RNAseq 研究 10 年...
RNA-Seq(RNA sequencing),也称为全转录组测序,是一种利用深度测序技术来研究样本的RNA组成的技术。这种技术能够提供关于细胞中RNA存在性和丰度的信息,可以用来鉴定和量化在特定时间点或条件下所有类型的RNA分子,包括mRNA、非编码RNA和小RNA。 RNA-Seq开始于RNA的抽取和纯化。接着,通常会使用一种叫作逆转录的过程将...
RNA-seq即转录组测序技术(Transcriptome sequencing),广义的定义为:对细胞内所有RNA(包括rRNA/ tRNA/ mRNA等)进行高通量测序,狭义的定义为:对细胞内mRNA进行高通量测序,临床检验实验室指的一般为狭义的转录组测序。 融合基因 融合基因(Fusion genes , FG)是...
转录组测序(transcriptome sequencing)是一种利用高通量测序技术来研究转录组的方法,也就是说,它可以用来测定一个特定生物或细胞类型的所有RNA分子。而RNA测序(RNA-seq)是转录组测序的一种,是一种利用深度测序技术特异性地研究转录组中的mRNA(信使RNA)水平的方法。
推荐测序产品 Ion AmpliSeq 转录组解决方案 Ion Proton 系统 Ion GeneStudio S5 系列测序仪 采用Ion Torrent NGS 技术进行的RNA测序 从靶向基因表达分析到全转录组测序,Ion Torrent™ 产品将简单的样品制备与直观的数据分析相结合,最终实现完整的 RNA 测序方案。
靶向RNA-Seq当对一组确定的基因组是感兴趣时,选择一组特定的转录本进行测序通常是可取的。使用全转录组测序无法分析的低表达基因也可以使用靶向RNA-Seq方法检测。常用的方法有两种,即靶向捕获和扩增子测序。靶向捕获方法涉及使用一组生物素化的探针来选择特定的基因,这些探针结合cDNA,66,75,76或RNA77结合(图2)。
RNA测序(RNA-seq)是转录组学研究的重要工具,也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性,转录组学有以下优势:1)能够动态考察细胞基因组的表达,多维度地反映差异变化;2)可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA,研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用;3)与蛋白组学...