通过结合新兴的三代长读长long-read和direct RNA-seq技术,以及更好的计算分析工具,RNA-seq帮助大家对RNA生物学的理解会越来越全面:从转录本在何时何地转录到RNA折叠以及分子互作发挥功能等。 前言 RNA测序(RNA-seq)自诞生起就应用于分子生物学,帮助理解各个层面的基因功能。现在的RNA-seq更常用于分析差异基因(DGE,...
RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...
图2 | 基于Sanger Method的自动化荧光测序技术 第二代测序技术（Short Read RNA-seq）第二代测序技术在测序方法上取得了重大突破，基于“边合成边测序”（sequencing by synthesis）和大规模平行测序技术（massive parallel analysis,MPS），使测序通量和读取速度得到极大提升，其中最具代表性的是Illumina Solexa测序仪。
RNA测序(RNA Sequencing,简称RNA-Seq,也被称为全转录物组鸟枪法测序Whole Transcriptome Shotgun Sequencing,简称WTSS),是基于二代测序技术研究转录组学的方法,可以快速获取给定时刻的一个基因组中RNA的种类和数量。 RNA-Seq有助于查看基因的不同转录本、转录后修饰、基因融合、突变/SNP和基因表达随时间的变化,或在...
转录组是指一个细胞、组织或生物体在特定条件或状态下转录的所有RNA集合。RNA-Seq利用新一代测序技术，通过测序细胞或组织中的所有RNA，分析其种类和丰度，从而获得基因表达的全景图。转录组测序的主要步骤包括：RNA提取、构建文库、测序和数据分析。二、转录组测序的主要步骤 RNA提取：从样本（如细胞、组织、血液等）...
高通量测序（High-throughput sequencing），也被称为第二代测序技术，是一种可以对DNA或RNA进行快速测序的技术。相比于传统的第一代测序技术，高通量测序能够在更短的时间内，同时测序更多的DNA或RNA样本。高通量测序的主要原理是将DNA或RNA分子随机断裂成大量小片段，并在流式细胞仪上进行高通量并行的测序。具体步骤...
RNA-Seq,即RNA测序技术,也称为转录组测序技术,是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、微RNA(miRNA)和非编码RNA(ncRNA),用高通量测序技术进行测序分析,反映出它们的表达水平。🚀 高通量测序技术 高通量测序技术(High-throughput sequencing),也称为“下一代”测序技术(Next...
RNA-Seq,即RNA测序又称转录组测序,是基于第二代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA,然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序,在此基础上进行片段的重叠组装,从而可得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解(globle)。进一步说,若和下一阶段的...
单细胞RNA测序(RNA-seq),是从2008年高通量测序变革阴影中出现的新一代测序(NGS)应用,当时有几个实验室报道了测定生物学样本RNA含量的不同方法。在过去的六年中,RNA-seq已经给我们展示了RNA世界的惊人多样性,从我们已经知道的转录合成蛋白质的mRNA,到在细胞中发挥调节作用的非编码RNA。相关阅读:利用RNA-seq研究非...