本书全面介绍了RNA-seq数据分析的基本原理和方法,内容涵盖数据分析的整个工作流程,包括质量控制、作图、组装、统计检验和代谢途径分析等。书中在进行理论讲解的同时,还使用了较多实例,不仅生物信息学家,甚至没有相关分析经验的研究人员也均可参照这些实例进行分析。
《RNAseq数据分析实用方法》是一本内容丰富、结构清晰、易于理解的书籍。无论是对RNAseq技术有基本了解的研究人员,还是希望深入掌握RNAseq数据分析技能的研究者,都可以从这本书中获得极大的帮助。精彩摘录精彩摘录在生物信息学领域,RNAseq数据分析是一个极其重要的研究方向。这本书《RNAseq数据分析实用方法》以其深入...
研究人员用RNA参照样本在全球多个实验室的Illumina HiSeq、Life Technologies SOLiD、Roche 454平台上进行检测,主要评估RNA测序在接头区域和差异性表达谱中的表现,并将其与芯片和定量PCR(qPCR)进行比较。研究表明,数据分析的算法会对RNA测序产生很大影响,不同算法生成的转录本数据存在很大差异。 前几天,浙江大学和哈佛大...
他们在这项研究中采用12种常见的方法,评估来自RNA-Seq的基因表达,发现有几百个基因的表达被一种或更多方法所低估。研究人员继而提出了一种两阶段的RNA-seq数据分析法,并将这种方法应用于最近发表的小鼠癌症研究,证实这种方法能够从被丢弃的数据中,提取到相关的生物学信号。
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RNA-seq数据分析实用方法 陈建国编著 新生物学丛 基因表达的量化和比较 RNA-seq数据分析导论 质量控制和预处理 转录组组装 籍 本店支持开发票 请联系客服索取 作者:E.科佩莱恩等编著;陈建国,张海谋译出版社:科学出版社 手机专享价 ¥ 当当价 降价通知 ¥140.35 定价 ¥184.32 配送至 陕西西安市 至...
融合事件可以使用RNA-Seq数据以及特定的生物信息学方法来检测。融合事件的检测通常通过含有融合接头的reads或融合基因的5 '端和3 '端之间的表达差异来揭示。常规的RNA-Seq方法通常对检测融合连接不够敏感。已经开发了几种方法,包括(1)富集RNA-Seq读取目的基因,(2)外显子捕获,(3)扩增子测序。在最近的一项研究中,...
single cell RNA-seq 提高了基因表达研究的分辨率,这项技术也带来越来越多的单细胞分析方法。这使得研究者难以驾驭这一多工具格局并从中搭建最新的工作流程来分析自己的数据。在这里,我们详细介绍了典型的单细胞 RNA-seq 数据分析步骤,包括预处理(质量控制、标准化、数据校正、特征选择和降维)以及细胞及基因水平的下游...