RNA-Seq技术,全称RNA测序技术,是一种高通量测序技术,用于分析细胞内转录本(即RNA)的组成和表达情况。这项技术通过测序RNA分子来研究基因表达、转录本的多样性、剪接变异、突变以及其他转录后调控机制。 RNA-Seq技术的工作原理是,首先从生物样本中提取总mRNA,并进行建库和测序。接着,对获得的下机数据进行质量控制,使...
本文将对第一代至第三代测序技术的原理和特点进行简要的介绍。注:除Direct-Seq外的测序技术都涉及到DNA链的合成,当用于RNA测序时,会先通过逆转录PCR(RT-PCR)合成cDNA文库,再进行测序。第一代测序技术(Sanger Method)第一代测序技术由Fred Sanger提出,被称为Sanger Method,是分子测序领域“从无到有”的...
一、RNA-seq技术简介 1.诞生于20世纪70年代的Sanger法是最早被广泛应用的DNA测序技术,也是完成人类基因组计划的基础。2.2005年以来,以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标志的新一代测序技术相继诞生,又称作深度测序技术。3.把高通量测序技术应用到由RNA逆转录生成的cDNA上,从而获得...
RNA-seq,即通过高通量测序技术进行的转录组测序分析技术。最初作为研究mRNA,small RNA,non-coding RNA 等表达水平、表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今, RNA-seq 在转录本变异、基因融合、可变剪切检测等场景均有大规模的应用。靶向 RNA-seq 则是对特定的转录本进行重点分析,与标准RNA-seq 类似...
RNA测序(RNA-seq)是转录组学研究的重要工具,也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性,转录组学有以下优势:1)能够动态考察细胞基因组的表达,多维度地反映差异变化;2)可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA,研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用;3)与蛋白组学研究相互补充...
1. RNA-seq技术,即转录组测序,通过高通量测序分析来反映mRNA、smallRNA、noncodingRNA等的表达水平。2. 作为二代测序领域最普遍的技术手段,转录组测序技术(RNA-seq)得到了广泛应用。随之而来的多种方法各具特色,竞相展示其独特之处。3. 传统方法通常需要富集mRNA,片段化mRNA,进行反转录并加接头...
RNA - seq技术呀,可有意思啦! RNA - seq就是对转录组进行测序分析的技术。那什么是转录组呢?简单说就是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和。这就像是一个细胞在某个时刻的“语言集”,RNA - seq就是要解读这个“语言集”的工具。 从原理上讲,RNA -seq的第一步就是提取RNA。这个过程就像...
本文将介绍RNA-seq的原理、方法和应用。 一、RNA-seq原理 RNA-seq的原理基于测序技术,通过将RNA样本转录成cDNA,然后进行高通量测序,最后利用计算方法分析测序结果。具体步骤如下: 1. RNA提取:从细胞或组织中提取总RNA,包括mRNA、rRNA、tRNA等各种类型。 2. RNA片段化:将提取的RNA进行片段化处理,通常采用酶或碱性...
而RNA-seq技术则是近年来兴起的一种高通量测序技术,逐渐替代了传统的microarray技术,成为了研究转录组学的主流方法之一。 二、RNA-seq的原理 1. 测序库构建 在进行RNA-seq实验之前,首先需要构建测序库。通常采用聚合酶链式反应(PCR)或者DNA和RNA的逆转录(Reverse Transcription)来将RNA转录成双链DNA,并添加barcode...