RNA-seq,即RNA测序技术,是一种基于高通量测序技术来分析转录组的方法。它能够对生物样品中的RNA分子进行定量和定性分析,主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、微RNA(miRNA)和非编码RNA(ncRNA)等,通过测序分析反映出它们的表达水平。 RNA-seq技术的主要流程 样品采集:获取生物样品。 RNA提取:从样品中提取RNA。 建库:构建...
RNA-Seq技术,全称RNA测序技术,是一种高通量测序技术,用于分析细胞内转录本(即RNA)的组成和表达情况。这项技术通过测序RNA分子来研究基因表达、转录本的多样性、剪接变异、突变以及其他转录后调控机制。 RNA-Seq技术的工作原理是,首先从生物样本中提取总mRNA,并进行建库和测序。接着,对获得的下机数据进行质量控制,使...
(转录组测序即RNA-seq分为bulk、single cell、single nucleus三种测序技术) 传统的转录组测序技术(bulk RNA-seq)是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水平,从而掩盖了不同细胞之间的表达异质性。 单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细...
英文: RNA-Seq and its applications:a new technology for transcriptomics 中文: 转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用更详细... 英文: A Review on The Processing and Analysis of Next-generation RNA-seq Data 中文: 新一代高通量RNA测序数据的处理与分析更详细......
《RNA-seq 数据分析实用方法》是科学出版社出版的图书,作者是[芬]E.科佩莱恩,[芬]J.图梅拉,[芬]P.萨默沃,[瑞典]M.赫斯,[芬]G.旺 内容简介 本书全面介绍了RNA-seq数据分析的基本原理和方法,内容涵盖数据分析的整个工作流程,包括质量控制、作图、组装、统计检验和代谢途径分析等。书中在进行理论讲解的...
PCR对RNA-seq的影响?PCR free是什么意思? 在文库制备过程中,我们通过标准的PCR来扩增随机的基因组片段。对于这些模板而言,有的二级结构复杂,有的则热稳定性不好,这些因素都会影响PCR扩增效率。因此,并非所有基因组序列都能在PCR扩增文库中同等体现。 在高通量测序中,之所以引入PCR方法,是为了对微量DNA样本进行扩增,...
《用RNA-Seq新技术筛选和鉴定与荔枝落果相关的基因》是依托华南农业大学,由李建国担任项目负责人的面上项目。项目摘要 该项目以华南特色果树荔枝为对象,落果是其生产中亟待解决的一个瓶颈问题,果实脱落与调控的分子机理也是当今果实发育领域研究的一个热点问题。该项目在科学严谨的田间试验设计(植物生长调节剂延迟和...
《RNA-Seq策略探索福氏志贺氏菌体内外表达谱差异》是依托中国人民解放军军事科学院军事医学研究院,由王恒樑担任项目负责人的面上项目。中文摘要 痢疾是由志贺氏菌引起的严重肠道传染病,在今后相当长时间内仍将是传染病防治工作中的重点。本项目计划拟通过以Solexa测序方法为基础的转录表达谱研究(RNA-Seq),获得...