RNA-Seq在检测能力和准确性方面表现出色,能够提供更全面、更准确的生物学信息。 四、数据重分析与可扩展性 RNA-Seq:随着转录组的新特征被不断发现,测序数据还可以重新分析。这使得RNA-Seq在大型研究和大量样品时具有可扩展性。 基因芯片:假设原始样品仍然可用,样品也必须重新走完整个芯片流程,从探针设计到实验室工作...
因此,研究表明,RNA-Seq可检测的差异表达基因比例比表达芯片更高,特别是低丰度的基因4,5。 索取Illumina的RNA-Seq 相关技术手册 检测选择性剪接位点和新型异构体以及非编码RNA的能力 除了基因表达谱分析,RNA-Seq还能鉴定选择性剪接异构体、剪接位点和等位基因特异的表达–所有这些都在单个实验中完成1,2。此外,RNA-Seq...
没有底线的检测芯片检测的动态范围比较窄，在转录本丰度很低的情况下，RNA-seq 才是你正确的选择。Tong 及其同事去年用 Illumina RNA-seq 平台和 Affymetrix 芯片，评估了大鼠肝脏在药物处理下的基因表达改变。他们发现，在检测丰度较高的基因时，RNA-seq 和芯片的结果基本一致。但在检测表达水平低的基因时，RNA-se...
RNA-seq在测表达量的同时还可以发现突变,基因芯片不能。 基因芯片(这里专指测RNA的表达谱芯片)确实不能发现突变。RNA-seq是通过测序来检测RNA丰度的,确实可以获得序列信息,但是因为测序本身有错误率,而RNA-seq常做的测序深度很低,得到的突变信息其实并不准确。要想准确,就需要极高的测序深度,那么又回到老问题了,...
RNA-seq对芯片的优势 RNA-seq检测基因表达主要在7个方面比基因芯片有优势。 RNA-seq存在的问题 RNA-seq测序之前需要一个比较复杂的文库构建过程,这个过程的每一步都可能带来误差甚至导致实验失败。如cDNA片段化、PCR扩增等都会带来偏倚,最终导致有的片段被反复测了多次,有的没有测到。rRNA去除不干净等因素也会带来...
尽管RNA-seq有那么多的优点,大家对芯片仍是情有独钟。那是因为,相比较于RNA-seq,芯片技术更加成熟,尤其是样本量比较大的研究。芯片在临床研究中也很吃香,因为它的数据处理又快又简单。芯片能提供高度一致的数据,分析软件也相当成熟。通过分析成百上千的样本,基因和...
前面我们介绍了表达量研究领域的,基因芯片和RNA-seq测序技术,并且把详细的学习资料和视频教程免费共享在了B站。 有学员提出来了一个问题,就是可以比较 同样实验设计的表达量探索研究,一个研究使用的是芯片,一…
RNA-seq是比基因芯片更先进的技术，其优势这里不多说了。既然它更先进，那么肯定是首选的技术。目前普遍...
RNA-seq的广泛应用促进了对许多生物层面的理解,如揭示了mRNA剪接的复杂性、非编码RNA和增强子RNA调控基因表达的机制。RNA-seq的发展和进步一直离不开技术发展的支持(湿实验方面和计算分析方面),且与先前的基于基因芯片的技术比起来,获得的信息更多、偏好性更小。到目前为止,已从标准的RNA-seq流程中衍生出多达100种不...
基因芯片和RNA-seq联合组织芯片分析CLDN8在 乳头状肾细胞癌的表达及意义 罡2,李生华2h 张观兰,李建棣2a,杨艺洲,许静婕,陈思智1,杨小萱1,陈 为联合基因芯片或RNA测序技术及免疫组织化学染色探究CLDN8在乳头状肾细胞癌(PRCC)中的表达及 摘要:目的 其临床意义。方法通过GeneExpressionOmnibus数据库、SequenceReadArchi...